甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点的发现与分析*
2011-07-24林强乾赵艳超张淑波陈维田
何 淼,林强乾,赵艳超,张淑波,陈维田
(1. 中山大学生命科学学院,广东 广州 510275;2. 香港理工大学屋宇设备工程系,香港 九龙)
甲型流感病毒包含8个独一无二的单链RNA片段,RNA松散地包埋在许多核蛋白(Nucleoprotein,NP)分子中,其中,包含3个病毒RNA聚合酶(PB1、PB2及PA)的复合体位于病毒颗粒的内核[1]。1990年,Ayae等[2]用梯度氯化铯离心法从甲型流感病毒中分离出RNA聚合酶,随后分离出了PB1蛋白、PB2蛋白和PA蛋白。
PB1蛋白,又称为聚合酶碱性蛋白1(Polymerase Basic Protein 1),由RNA片段2编码。它在RNA聚合酶复合体中的作用是负责病毒RNA分子的延伸,同时也在模版RNA合成的延伸过程中起作用。PB1蛋白酶定位在感染细胞的细胞核中[1]。研究表明,PB1蛋白的第506-659位氨基酸的保守性不显著,但是,仍分布有许多零星的保守片断,这些保守片段是否代表蛋白表面氨基酸或相互作用位点仍需检验。
PA蛋白,又称为聚合酶酸性蛋白(Polymerase Acid Protein),由RNA片段3编码。是RNA聚合酶复合体中的最后一个蛋白,它对病毒RNA聚合过程的作用未知。有证据表明,它可能起着蛋白激酶或螺旋解构酶的作用。PA聚合酶也定位在感染细胞的细胞核中[1]。Amelia等通过重组的猿40病毒,用蛋白片断缺失法分析了PA蛋白的区域,研究显示,区域I(124-139位氨基酸)与区域II(186-247位氨基酸)具有重要功能;两个核定位信号均存在于区域I与区域II中,结论表明,PA蛋白包含一个核定位信号区域,是病毒执行繁殖复制的重要区域[3]。
大部分蛋白质需要相互作用才能发挥出其生物学作用。通过构成复合体才能发挥生物学作用的蛋白质,在相互作用面上的结构域或序列,具有比一般功能的结构域更高的保守度。……
