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RNA干扰抑制肺腺癌细胞HMGA1表达对化疗敏感性的影响

2011-06-07金志良孙新臣徐炎华

实用癌症杂志 2011年3期
关键词:吉西质粒载体

金志良 孙新臣 徐炎华

高迁移率族蛋白组A1(high mobility group A1,HMGA1)可能是1种癌基因,它能促进细胞恶性转化、肿瘤细胞增殖和侵袭,抑制其凋亡。近年来,RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术的出现,为研究内源性基因功能和信号转导途径提供了强有力的研究工具。本研究旨在构建HMGA1siRNA慢病毒载体并转染肺腺癌细胞SPCA-1,沉默HMGA1的表达,观察其对细胞化疗敏感性的影响。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

慢病毒载体系统(上海吉凯基因公司);吉西他滨(江苏豪森药业股份有限公司);RPMI1640(GIBCO公司);HEPES(Amresco公司);胎牛血清(天津TBD公司);四甲基偶氮唑蓝(MTT,美国Siga公司);Annexin V-FITC细胞凋亡检测试剂盒(南京凯基公司);Trizol(美国Invitrogen公司)和TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0(大连宝生物公司);羊抗人HMGA1多抗(Santa Cruz 公司),小鼠抗羊IgG(北京中杉公司);人肺腺癌细胞株SPCA-1、慢病毒包装细胞293T细胞株和大肠杆菌菌株DH5α(中科院上海细胞库)。

1.2 细胞培养

人肺腺癌细胞株SPCA-1于含10%胎牛血清的RPMI 1640培养液中培养,置于37℃下5%CO2水饱和培养箱中。细胞贴壁生长良好,每3天传代1次。

1.3 人HMGA1基因shRNA模板序列的设计

前期实验筛选出最有效的HMGA1-siRNA(siHMGA1)序列是:AAACCACCACAACTCCAGGAA。以此序列为模板,根据碱基互补配对原则设计寡核苷酸链,在互补两条序列中间加入Loop,序列为TTCAAGAGA,使寡核苷酸可以形成发夹结构,寡核苷酸序列两端分别带有酶切位点。正义链: 5′-TAAAC CACCA-CAACTCCAGGAATTCAAGAGATTCCTGGAGTTGTGGT-GGTTTTTTTTTC-3′;反义链:5′-TCGAGAAAAAAAAACCACCACAACTCCAGGA ATCTCTTGAATTCCTGGAGTTGTGGTGGTTTA-3′。阴性对照双链寡核苷酸转录产物所形成的siRNA的作用序列为:5′-TTCTCCGAACGTGTCACGT-3′,此序列不与任何人类基因序列同源。

1.4 实验方法

1.4.1 siHMGA1慢病毒表达载体的构建 按照设计好的双链DNA进行合成、退火,DNA稀释到1 μg/μl,退火反应体系如下:DNA模板单链正义链 5 μl,DNA模板单链反义链5 μl,5×Universal Buffer 20 μl,dd H2O 70 μl,总体积100 μl混匀,90℃温育4 min,70℃温育10 min,缓慢冷却至室温,稀释至终浓度100 ng/μl。将退火产物与线性化处理的载体片段连接,将连接产物转化到DH5α感受态细胞,将150 μl已转化的感受态细胞转移到含20 mmol/L MgSO4和Amp抗性的SOB琼脂培养基上,将平板置于室温直至液体被吸收,倒置平皿,于37℃培养16 h进行阳性克隆筛选。

1.4.2 PCR和DNA测序鉴定 挑取10个单菌落,使用载体多克隆位点两端的引物进行PCR扩增,其中上游引物:5’- GCCCCGGTTAATTTGCATAT -3’;下游引物:5’- GTAATACGGTTATCCACGCG -3’。PCR体系如下:上下游引物各0.4 μl,MgCl20.5 μl,Taq polymerase 0.2 μl,DNTPs(2.5 mmol/L) 0.8 μl,ddH2O 14.7 μl,10×buffer 2.0 μl,Template 1 μl。 PCR反应条件:94℃预变性2 min,94℃变性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸30 s(从第二步到第四步共30 cycle),最后72℃延伸6 min。 PCR反应结束后,取PCR产物5 μl上样,进行1.5%琼脂糖凝胶电泳。挑选阳性克隆,接菌,过夜培养后,应用质粒抽提试剂盒提取质粒,抽提好的质粒应用载体上的引物送测序(上海英俊公司完成)。

1.4.3 携带siHMGA1的慢病毒重组体的包装 胰蛋白酶消化对数生长期的293T细胞,调整细胞密度为0.6×109/ L,接种于15 ml的细胞培养瓶中,37℃、5%CO2培养箱内培养,细胞密度达70%~80%时进行转染。使用慢病毒包装质粒混合物和构建好的慢病毒质粒共转染293T细胞,转染48 h后,收集细胞上清液,4℃、4 000 r/ min离心10 min除去细胞碎片,以0.45 μm滤器过滤上清液于40 ml超速离心管中。把病毒粗提液样品加入到过滤杯中并盖上盖子,将过滤杯插到含滤过液收集管中,4 000 r/ min离心约10~15 min,取出离心装置,将过滤杯和下面的滤过液收集杯分开,过滤杯中的即为病毒浓缩液。将病毒浓缩液分装到病毒保存管中,-70℃保存。

1.4.4 细胞转染 胰蛋白酶消化对数生长期的SPCA-1细胞,调整细胞密度为0.6×109/ L,接种于15 ml的细胞培养瓶中,37℃、5%CO2培养箱内培养,细胞密度达70%~80%时进行转染。构建好的HMGA1siRNA慢病毒质粒和阴性siRNA慢病毒质粒,按MOI值50转染SPCA-1细胞,并分为阳性组、阴性组和空白组(未转染的细胞),转染后4天,显微镜下观察细胞生长良好。

1.4.5 RT-PCR检测HMGA1mRNA表达 各组对数生长期的细胞用Trizol试剂盒(Invitrogen公司)抽提总RNA。RT-PCR步骤按照TaKaRa RNA PCR Kit(AMV)Ver.3.0说明书进行。HMGA1引物序列为5/-CTACTTTGCTTCCGCCACTC-3/,5/-GTGGCCCCTACACCCTTTAT-3/,扩增长度为419 bp;内参β-actin引物序列为5/-ACACTGTGCCCATCTACGAGG-3/,5/-AGGGGCCGGACTCGTCATACT-3/,扩增长度为621 bp。以上引物均由上海生物工程公司合成。RT条件:42℃ 30 min,99℃ 5 min,5℃ 5 min。PCR条件:94℃ 2 min,94℃ 30 s,59℃ 30 s,72℃ 30 s,28个循环,72℃延伸10 min。PCR产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳(100V,30 min)。Imagemaster VDS凝胶成像系统成像。

1.4.6 Western印迹检测HMGA1蛋白表达 用细胞裂解缓冲液裂解细胞,BCA 蛋白定量试剂盒检测总蛋白浓度。取2 0 μg蛋白经1 0 %聚丙稀酰胺凝胶电泳,1 2 0V 恒定电压转膜2 h,室温封闭1 h,4 ℃封闭过夜。HMGA1一抗工作浓度为1∶500,作用1 h; 二抗工作浓度1∶1 000,作用50 min,β-actin 一抗工作浓度为1∶600,二抗工作浓度为1∶1 000,抗体的反应时间同HMGA1。然后按说明书滴加ECL发光液,反应5 min 后,入暗室曝光10 min,显影、照相。

1.4.7 MTT检测细胞增殖情况 取阳性组和阴性组指数生长期细胞,以5 000个/孔接种于96孔培养板中,每组设6个复孔,24 h后换为不同浓度吉西他滨(0.005 μg/ml、0.05 μg/ml、0.5 μg/ml、5 μg/ml、50 μg/ml)的培养液,并设空白对照组和阴性对照组。培养72 h后每孔加MTT 20 μl(5 mg/ml)再培养4 h,弃上清,加入150 μl二甲基亚砜(DMSO),振荡10 min,使结晶物充分溶解。置酶联免疫检测仪上,570 nm波长下,以空白孔调零,测定各孔光吸收值(A)。按下列公式计算细胞抑制率:

抑制率(%)=(1-给药组平均A值/对照组平均A值)×100%

1.4.8 流式细胞术检测 将阳性组和阴性组指数生长期的细胞培养24 h后,换成含不同浓度吉西他滨(0.05 μg/ml、0.5 μg/ml、5 μg/ml)的培养液干预72 h后,收集约106个细胞,用PBS洗涤细胞2次。按试剂盒说明操作后应用流式细胞仪检测。

1.5 统计学分析

2 结果

2.1 携带目的基因慢病毒质粒的鉴定

2.1.1 PCR结果 PCR反应结束后,取产物5 μl上样,1.5%琼脂糖凝胶电泳,重组慢病毒载体的PCR产物是381 bp(插入片段59 bp),经双酶切后没有插入片段的pGCL-GFP空载体PCR产物是322 bp,鉴定结果与预期的相符,见图1。

2.1.2 DNA测序鉴定 DNA测序的结果与实验要求的DNA序列完全一致(图2)。对于测序结果正确的克隆,进行不含内毒素质粒的提取,提取完成之后,用蛋白核酸测定仪(Eppendorf,PS232C) 测量Lentivector-siHMGA1 plasmid DNA,D260/D280 值为1.9,表明获得了纯度和完整性均较高的质粒DNA。

图1 慢病毒质粒PCR产物电泳图

1为空白对照 (ddH2O),2为DNA 标记,3为阴性对照(空载体322 bp),4~8为HMGA1慢病毒质粒(381 bp)

图2 慢病毒质粒DNA测序结果

2.2 RNAi下调SPCA-1细胞HMGA1mRNA表达水平

半定量RT-PCR结果,以琼脂糖凝胶电泳条带的亮度来判断HMGA1的mRNA表达高低,结果显示阳性组HMGA1mRNA的表达量明显低于阴性组和空白组(后两组间无差异,P>0.05),说明干扰的效率很高(图3)。

图3 RT-PCR检测结果

1为DNA标记,2为阳性组,3为阴性组,4为空白组

2.3 RNAi下调SPCA-1细胞HMGA1蛋白表达水平

Western blot结果以蛋白条带的亮度来判断HMGA1的蛋白表达高低,结果显示阳性组HMGA1 mRNA的表达量明显低于阴性组和空白组,说明干扰的效率很高(图4)。

图4 Western blot检测结果

1为阳性组,2为阴性组,3为空白组

2.4 吉西他滨对阳性组、阴性组细胞的体外增殖抑制效应

分别以0.005 μg/ml、0.05 μg/ml、0.5 μg/ml、5 μg/ml、50 μg/ml吉西他滨处理各组细胞72 h后,阳性组较阴性组抑制率明显升高 (图5)。根据MTT吸光值计算IC50值,阳性组为(0.309±0.003)μg/ml,阴性组为(0.653±0.003)μg/ml,两组比较具有差异性(P<0.05)。

2.5 吉西他滨对阳性组和阴性组细胞凋亡率的影响

细胞经0.05 μg/ml、0.5 μg/ml和0.5 μg/ml吉西他滨处理72 h后,阳性组凋亡率分别为(9.53±0.42)%、(16.67±0.45)%和(25.40±0.79)%,阴性组凋亡率分别为(7.43±0.21)%、(11.00±0.20)%和(14.93±0.31)%,差异具有显著性﹙P<0.05﹚,见图6。

图5 不同浓度吉西他滨作用下2组细胞生长抑制曲线和IC50值

图6 不同浓度吉西他滨作用下2组细胞凋亡率情况

A~C为阳性组;A1~C1为阴性组

3 讨论

慢病毒介导的RNA干扰(RNA interference,RNAi)是由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)引发的转录后基因沉默机制(posttranscriptional gene silencing,PFGS)。dsRNA经RNA沉默复合体(RNA-induced silencingcomplex,RISC)降解成21-23nt的小干扰RNA(short Interference RNA,siRNA),并以其为模板,特定位点和特定间隔地降解与之序列互补的mRNA。RNAi具有快速、有效、容易操作和序列特异性强等优点。近年来的研究表明以慢病毒为载体可以明显增加RNA干扰的转染和干扰效率[1]。因此,本实验选择慢病毒为载体。本实验结果表明,通过慢病毒转染HMGA1基因的干扰序列到肺癌细胞后,无论是在RNA水平和蛋白水平目的基因几乎不表达,说明该种方法效率高、可操作性强。成功的下调肺癌细胞中HMGA1基因的表达为我们后面的实验奠定了基础。

人的HMGA1基因是高迁移率族蛋白HMG(high mobility group protein)中的一员,又称为HMGI(Y)基因,位于染色体的6p21。研究表明正常成年个体组织中HMGI(Y) 基因很少表达甚至不表达,然而在胚胎的发育过程中和恶性肿瘤中的表达水平却很高,而且一般来说,HMGI (Y) 基因表达水平的高低与肿瘤的恶性程度有关[2]。这与它的结构和功能有关,它最显著的特点是拥有3个相似但又相互独立的特殊结构,该结构能和DNA中富含A-T序列的小沟结合,称为A-T沟序列,它含有3个碱性八肽的DNA结合模体,该模体的核心结构是BBXRGRXB,B(G或R)代表碱性氨基酸,X是甘氨酸或脯氨酸[3]。这类蛋白质通过A-T沟序列优先与DNA小沟中富含AT的序列结合,诱导增强子所调控的启动子发生结构特异性的变化,使相应的转录因子在同一识别位点与大沟发生相互作用,或者直接与HMGI(Y) 蛋白发生作用,从而进一步增强转录,调控肿瘤相关基因表达和细胞分化[4,5]。从而使正常细胞恶变和转化,肿瘤细胞侵袭和转移。本实验RT-PCR和Western blot证明该基因在肺癌细胞中的表达也很高,表明HMGA1基因可能对肺癌细胞生长、分化和恶变起到调控作用,有可能是肺腺癌细胞发生发展的关键因子之一。

当通过RNA干扰技术下调肺癌细胞中的HMGA1基因表达后,在吉西他滨的干预下阳性组生长抑制率明显高于阴性组进一步说明:一方面该基因可能调控肺癌细胞分化、生长和增殖以及肿瘤细胞相关基因表达,当它表达下调后,吉西他滨抑制阳性组细胞生长的能力相对增强;另一方面说明该基因是影响肺癌细胞化疗敏感性的重要基因之一。后者与近年来文献的报道是一致的[6]。研究还发现在相同浓度吉西他滨的作用下,低表达HMGA1的阳性组比高表达HMGA1阴性组凋亡率要高,表明HMGA1基因表达下调后药物敏感性的改变可能是和细胞凋亡机制有关。近年来,研究表明HMGA1具有抗凋亡的作用,其具体抑制凋亡的机制还不是很清楚,可能是通过作用于凋亡基因p53的活化剂HIPK2,阻止它进入细胞核,抑制它的活化,从而抑制p53基因的功能,阻止细胞凋亡[7,8];也可能是通过激活磷脂酰肌醇3激酶和(或)蛋白激酶B信号途径(PI3K/Akt)中的Akt,后者进一步抑制凋亡蛋白酶Caspase-3和Caspase-9的活性,从而抑制细胞凋亡[6]。另外,吉西他滨抗肿瘤作用之一就是诱导细胞凋亡。所以,当肺癌细胞中的HMGA1表达下调后,其抗凋亡作用减弱,吉西他滨诱导阳性组细胞凋亡的比例增加。

综上所述,HMGA1基因表达下调后能够增加肺癌细胞对吉西他滨的敏感性,其机制可能和抑制其抗凋亡作用有关,具体的信号途径还不是很清楚,有待进一步研究。

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