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脑胶质瘤MGMT启动区甲基化PCR检测方法的对比分析

2011-04-28李杰飞孙彦辉刘福生金贵善张红波

首都医科大学学报 2011年4期
关键词:检测

李杰飞 孙彦辉 刘福生 金贵善 柴 奇 张红波

(北京市神经外科研究所脑肿瘤研究中心,首都医科大学附属北京天坛医院神经外科,北京 100050)

异常的甲基化和各种基因的失活在恶性肿瘤中很常见。甲基化的检测方法有很多种,近些年临床上常用的检测方法是甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)法。本研究采用传统MSP和巢式MSP两种方法来检测MGMT启动区甲基化的状态,并采用免疫组织化学的结果作为两种MSP法检测结果的参考,比较这两种方法的优缺点,为以后临床广泛开展此项检测和脑胶质瘤患者化疗方案的制订提供较为可靠的依据。

1 材料和方法

1.1 肿瘤标本的收集

随机收集2009年4月至2010年3月首都医科大学附属北京天坛医院神经外科收治的54例脑胶质瘤患者的肿瘤标本,其中男性28例,女性26例,年龄19~74岁,平均(46.2±14.40)岁。根据胶质瘤分类分级标准[1],星形细胞瘤7例,少枝胶质细胞瘤2例,少枝-星形细胞瘤16例,间变性星形细胞瘤1例,间变性少枝胶质细胞瘤2例,间变性少枝-星形细胞瘤3例,胶质母细胞瘤23例。其中在38例胶质瘤中获得了肿瘤中心和周边两个不同部位的标本,共获得92份标本,其中有77份标本可以分成两部分,一部分保存在液氮中,用于DNA提取,另一部分保存在10%的甲醛中,用于石蜡切片。另外15份标本由于标本量少,只检测了MGMT启动区甲基化的状态。

1.2 DNA提取和亚硫酸氢盐的修饰

采用基因组DNA快速提取试剂盒(由北京金驰同信科技发展有限公司提供)提取DNA。用DNA甲基化修饰试剂盒(由北京天漠科技开发有限公司提供)对上述抽提的基因组DNA进行亚硫酸氢盐修饰。……

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