乳腺癌线粒体细胞色素氧化酶-Ⅱ基因突变检测
2011-02-06闫斌韩丽红于跃利
闫斌 韩丽红 于跃利
乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,在我国占全身各种恶性肿瘤的7%~10%。近年来,线粒体DNA(m itochond rial DNA,m tDNA)突变与肿瘤关系的研究越来越受到人们的重视,并且在多种人类肿瘤中都已检测到m tDNA突变。本研究拟通过对乳腺癌组织m tDNA的细胞色素氧化酶-Ⅱ区测序分析,了解中国人乳腺癌m tDNA的细胞色素氧化酶-Ⅱ的突变情况,以期为乳腺癌病因学的研究提供实验依据,并为临床乳腺癌的诊断和治疗提供参考。
1 材料与方法
1.1 材料
随机收集2008年1月~2009年1月在包头医学院第一附属医院普外科切除的乳腺癌组织标本20例,以及对应的癌旁组织标本,标本取回后于-80℃冰箱保存,均经该院病理科证实为乳腺癌。
1.2 乳腺癌组织标本m tDNA的细胞色素氧化酶-Ⅱ区PCR扩增
按照DNA提取试剂盒((Prom gea公司)说明书提取20例乳腺癌组织和癌旁组织的DNA。通过软件分析设计出一对引物,上游引物:5’-atggcacatgcagcgcaag t-3’,下游引物:5’-ggtaaatacgggccctatttc-3’。PCR反应体系50μL,水33.5μL,10×bu ffer(无M g2+)5μL,上、下游引物各1μL,4×dNTP4μL,25mM的Mgcl24μL,Taq DNA聚合酶0.5μL(试剂均来自Promega公司),DNA模板1μL。PCR反应条件:94℃5m in;94℃15s,65℃30s,72℃40s,35个循环。产物于1%琼脂糖凝胶中电泳,电压120V,电泳30m in。凝胶成像分析系统观察记录结果。
1.3 测序及分析
由百泰克公司使用A BI3730X L测序仪对PCR扩增产物进行测序。测序果用Bioed it软件进行分析,与Gen Ban k序列(AC_000021)对比,在PUBMED网上进行氨基酸序列比对,确定是否为突变。
2 结果
2.1 细胞色素氧化酶-Ⅱ PCR扩增产物结果,见图1。
2.2 细胞色素氧化酶-Ⅱ测序结果统计
见表1。20例乳腺癌患者癌组织中共有4例m tDNA细胞色素氧化酶-Ⅱ区存在突变,突变率为20%。癌旁组织中共有2例m tDNA细胞色素氧化酶-Ⅱ区存在突变,突变率为10%。……
