胃癌组织中p16基因甲基化水平以及mRNA表达的关系
2010-06-07朱新江
朱新江* 张 凯 秦 伟 冯 禄
胃癌是全世界最常见的恶性肿瘤之一,在我国胃癌病死率为25.2/10万(男性32.8/10万,女性17.0/10万),占全部恶性肿瘤死亡的23.2%(男性是女性的1.9倍),严重威胁人民群众的生命健康。近几年,表遗传学改变的研究取得了突飞猛进的进展,成为胃癌临床基础研究的一个前沿阵地。p16基因是已经确认的最重要的抑癌基因之一,在胃癌细胞凋亡过程中起着重要作用[1-3]。
1 材料与方法
1.1 一般资料

表1 p16基因和GAPDH的RT- PCR引物序列及PCR条件

表2 p16基因甲基化和非甲基化引物序列及PCR条件
选择2005年1月至2008年1月抚顺市中心医院普外科切除的胃癌患者50例,男44例,女6例,年龄40~74 岁,平均(58±9.76)岁。手术取下的新鲜标本立即浸入液氮中后置于-70℃冰箱保存。 Wizard DNA cleap up 纯化试剂盒(美国Promega公司),亚硫酸氢钠(美国Sigma公司),SYBR GreenI 实时定量PCR逆转录试剂盒(日本TaKaRa公司),TRIzol(美国Invitrogen公司),Taq酶和dNTP(日本TaKaRa公司)引物(北京三博远志生物技术有限公司)。
1.2 实验方法
1.2.1 RT-PCR分析胃腺癌标本中p16基因MRNA的表达
用TRIzol 试剂一步法分别提取胃癌组织总RNA(按说明书进行)。按照反转录试剂盒说明将其反转录成cDNA第一链。PCR反应条件:首先进行预变性,时间为4min,预变性温度为93℃。预变性之后进行35个循环:温度和时间分别为 92℃ 30s、51℃ 30s,71℃ 45s,最后延伸10min温度为72℃。用琼脂糖凝胶上电泳分离PCR产物,GB染色,利用凝胶成像分析系统检测PCR产物吸光度值,将各基因与GAPDH吸光度比值作为其mRNA水平的相对值,mRNA表达水平取其平均值进行统计分析。
1.2.2 甲基化特异性PCR检测p16基因启动子区DNA甲基化
首先用酚-氯仿分别提取胃癌组织中基因组DNA,并用紫外分光光度仪进行定性、定量。……
