胸膜肺炎放线杆菌血清1型与5型基因组DNA差异基因的筛选与鉴定
2010-05-21韩文瑜杜崇涛杨舒心雷连成
谢 芳,韩文瑜,杜崇涛,周 靓,杨舒心,雷连成*
(1.吉林大学畜牧兽医学院,吉林 长春 130062;2.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/动物细菌病研究室,黑龙江 哈尔滨 150001)
猪传染性胸膜肺炎(Porcine contagious pleuropneumonia,PCP)是由胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacillus pleuropneumoniae,APP)引起,以胸膜肺炎和出血性坏死性肺炎为特征,一种高度传染性、致死性呼吸系统疾病[1],呈世界性分布,给养猪业造成重大经济损失。根据荚膜多糖和脂多糖抗原性的不同将APP分为15个血清型[2],其中血清型1、5、9和11毒力最强,其他血清型如3型和6型的毒力较低[3]。APP各血清型间的致病性和免疫原性有明显差异,没有或仅有较弱的交叉反应,导致不同血清型间缺乏交叉保护力[4]。由于APP致病机理尚不明确,全基因组序列未完全测定,APP各血清型间的差异基因鲜有报道,因此,无法确认导致APP各血清型间感染和致病性差异的原因,使该菌引起的PCP的防制十分困难。
代表性差异分析(Representational difference analysis,RDA)是一种鉴定、分离差异基因的技术。该技术将差减杂交方法与PCR技术相结合,应用识别4个碱基的内切酶充分消化测试组(Tester)和驱动组(Driver)的DNA,PCR富集两组DNA片段,经过3次差减杂交,去除共有基因,利用PCR技术富集测试组中特异基因的DNA片段。该技术与其他消减杂交技术相比,是一种相对高效、敏感和特异的差异基因筛选方法,应用广泛[5]。本研究以APP血清1型和5型为研究对象,利用RDA技术,分别筛选APP血清1型和5型的差减基因,为APP不同血清型间基因差异的研究奠定基础,同时,也为APP感染致病机理的研究及新型疫苗的开发提供依据。……
