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新橙皮苷治疗溃疡性结肠炎的网络药理学研究及实验验证

2024-05-28吴与伦张欣然沈阿灵刘丽雅魏丽慧陈友琴

福建中医药 2024年3期
关键词:橙皮靶点结肠

吴与伦,张欣然,沈阿灵,刘丽雅,魏丽慧,陈友琴,方 翌*

(1.福建中医药大学中西医结合学院,福建 福州 350122;2.福建省中西医结合老年性疾病重点实验室,福建 福州 350122;3.福建中医药大学科技创新与转化中心,福建 福州 350122;4.美国凯斯西储大学医学院,俄亥俄州 克利夫兰 44106)

溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种慢性炎症性肠病,以黏膜和胃肠道生理改变为特征,临床表现为腹痛、便血、腹泻、体质量减轻,但目前其发病机制尚不清楚[1]。UC 的主要病机以湿热瘀血为标,脾肾亏虚为本;清热化湿散瘀、止泻止痢为其治法治则[2]。中医药治疗UC 的历史悠久,临床疗效确切,抗炎效果显著[3]。清化肠饮是临床治疗UC 的常用方,方中厚朴苦燥降泻,辛散温通,入大肠经,是中医学治疗胃肠疾病要药[4]。新橙皮苷作为厚朴中的活性成分,在最新的研究中被证实具有较强的抗炎、抗氧化、免疫调节等作用,可减轻DSS诱导的UC 小鼠结肠黏膜组织病理损伤,但其治疗UC 中的作用机制尚未明确[5-7]。因此,本研究拟采用网络药理学分析和体内实验,初步探讨新橙皮苷治疗溃疡性结肠炎的相关机制,以期阐明新橙皮苷治疗UC 的新机制和新靶点,为临床研发治疗UC 药物提供新的实验依据。

1 实验材料

1.1实验动物 30 只雄性SPF C57BL/6J 小鼠,8~10 周龄,体质量(21±3)g,购自上海SLAC 实验动物科技有限公司,所有动物均饲养于福建中医药大学实验动物中心SPF 级实验室,动物使用许可证编号:SYXK(闽)2020-0002。本实验已通过福建中医药大学伦理委员会批准(FJTCM IACUC 2022185)。

1.2实验药物的配制 新橙皮苷给药剂量按照人与动物体型系数换算,每只小鼠按照0.1 mL/10 g 的灌胃剂量配制药物,以蒸馏水配置0.5、5、50 mg/(kg·d)的新橙皮苷混悬液,超声4~5 h 至液体充分溶解澄清透明,每日现配现用。

1.3实验试剂 DSS 购自美国MP Biochemicals 公司(货号:0216011080-100 g);新橙皮苷购自北京MedChemExpress 有限公司,纯度>98.48%(货号:HY-N0101);便隐血(OB)试剂(匹拉米洞法)购自珠海市贝索生物技术有限公司(货号:BA2020B);4%多聚甲醛固定液、苏木素溶液购自北京索莱宝公司(货号:LA0427、G1140);免疫组化超敏Ultra-SensitiveTMSP 试剂盒购自福州迈新生物技术有限公司(货号:KIT-9710);p-p38 一抗购自南京SAB公司(货号:12322);p38 一抗购自美国CST 公司(货号:8690)。

1.4实验仪器 生物组织脱水机和生物组织石蜡包埋机购自湖北孝感亚光有限公司;全自动石蜡切片机和倒置显微镜购自德国Leica 公司;荧光正置显微镜购自日本Nikon 公司。

2 实验方法

2.1溃疡性结肠炎疾病靶点的收集 以“ ulcerative colitis”为检索词,在GeneCards 数据库(https://www.genecards.org/)和DisGenet(http://www.disgenet.org/)2 个数据库中检索UC 的相关人类基因靶点,并将2 个数据库中的靶点取并集并删除重复项。

2.2新橙皮苷作用靶点预测 在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,https://tcmspw.com/tcmsp.php)、中医药整合药理学研究平台(TCMIP,http://www.tcmip.cn/TCMIP/index.php)、Swisstargets数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/)、Sym-Map(http://www.symmap.org/)、BATMAN-TCM(http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/)中检索新橙皮苷潜在蛋白靶点,利用Unitprot 数据库(http://www.Unitprot.org/)将获取的蛋白靶点校准其基因名并删除重复项,与UC 的疾病相关靶点取交集获得的新橙皮苷治疗UC 的潜在靶点。

2.3GO 和KEGG 富集分析 将“2.2”项中预测的新橙皮苷治疗UC 的潜在靶点基因名输入DAVID数据库(https://david.ncifcrf.gov/)中,设置物种为“ homo sapiens”,进行GO 和KEGG 富集分析,筛选P<0.005的结果,从中选取KEGG 通路富集排名前20和GO 分类富集排名前10 的结果,使用R-Studio 软件对结果进行可视化,并分别绘制相应气泡图。

2.4构建靶点相互作用(PPI)网络 将“2.2”中新橙皮苷治疗UC 的潜在靶点基因名导入STRING 生物信息学数据库(https://string-db.org/),设置物种为“ homo sapiens”,置信度设定>0.9,获取作用靶点的互作信息。通过Cytoscape 3.7.2 软件绘制PPI 网络图,并对网络图进行拓扑结构分析,确定新橙皮苷治疗UC 的核心靶点。

2.5小鼠溃疡性结肠炎模型的构建 采用口服2%葡聚糖硫酸钠(DSS)溶液的方法建立溃疡性结肠炎模型[8],让小鼠自由饮用7 d 2% DSS 溶液,DSS溶液每天更换1 次,第8~10 d 恢复正常饮水,第11 d 取材,期间正常饮食。

2.6分组与干预 小鼠适应性喂养7 d 后,在开始构建模型前,通过随机数字表法将其分为对照组、模型组和低、中、高剂量组,每组6 只。构建模型后,对照组和模型组小鼠使用蒸馏水灌胃,低、中、高组(具体剂量参见“1.2”)使用配置好的不同浓度新橙皮苷溶液灌胃。

2.7疾病活动指数(disease activity index,DAI)评分及体质量变化计算 造模期间每日通过盲法评估每只小鼠临床特征:包括粪便性状、体质量改变和便血程度情况,并参考JACKSON 等[9]的评估标准计算DAI 评分。同时,每日记录小鼠体质量与给药第1 天变化百分比,绘制小鼠体质量变化百分率折线图[10-11]。

2.8结肠组织免疫组化检测 给药干预11 d 后取材,小鼠结肠组织固定于4%多聚甲醛中;24 h 后,进行组织梯度乙醇脱水及二甲苯石蜡透明,将结肠组织包埋于石蜡,切成4 μm 切片,用显微镜载玻片承载后60 ℃烘烤5 h,将其脱蜡至水化,以0.25%TritonX-100 的PBS 溶液破膜10 min。随后,阻断内源性过氧化物酶活性10 min,并用封闭液阻断抗体非特异性结合1 h。将切片与p-p38 或p38 抗体在4 ℃下孵育过夜,然后与酶标二抗孵育1 h。最后使用二氨基联苯胺(DAB)试剂盒和苏木素对样本进行染色,然后在镜下观察并拍照。

2.9统计学方法 采用SPSS 26.0 统计软件对数据进行分析。计量资料服从正态分布以(±s)表示,多组间体质量变化和免疫组化阳性率比较采用单因素方差分析;不符合正态分布的数据用[M(P25,P75)]表示,多组间DAI 评分比较采用秩和检验进行分析。P<0.05 为差异具有统计学意义。

3 结 果

3.1新橙皮苷治疗UC 的潜在作用靶点 由Gene-Cards 数据库和DisGenet 数据库检索获得2 374 个UC 疾病作用靶点,TCMSP、Swiss Target Prediction、TCMIP、SymMap、BATMAN-TCM 数据库检索合计获取101 个新橙皮苷作用靶点。将新橙皮苷潜在蛋白靶点与UC 相关疾病靶点相映射,二者交集获得51 个新橙皮苷治疗UC 的潜在靶点,见图1。

图1 新橙皮苷治疗UC 的潜在靶点

3.2GO 功能富集分析 采用DAVID 数据库对新橙皮苷治疗UC 的潜在靶点进行GO 功能富集分析,获得50 个涉及生物过程(biological process,BP),包括对外源性刺激的反应、胶原分解代谢过程、细胞外基质分解、蛋白水解、基因表达的负调控、环氧合酶途径等,见图2;20 个细胞组分(cellular component,CC),包括细胞外基质、细胞外间隙、大分子复合物、外泌体、细胞质膜等,见图3;42 个分子功能(molecular function,MF),包括内肽酶活性、金属内肽酶活性、丝氨酸内肽酶活性、酶结合、相同蛋白质结合、转录共激活因子结合等。见图4。

图2 新橙皮苷生物过程分析图

图3 新橙皮苷细胞组分分析图

图4 新橙皮苷分子功能分析图

3.3KEGG 通路分析 使用DAVID 数据库对潜在靶点进行KEGG 通路分析,得到66 条通路,根据富集的基因数的多少进行排序,整理出排名前20 名,绘制气泡图。这些交潜在靶点主要富集的通路包括MAPK 信号通路、癌症的发病途径、化学致癌-活性氧、内分泌耐药、雌激素信号通路、糖尿病并发症的AGE-RAGE 通路、IL-17 信号通路等。见图5。

图5 潜在靶点KEGG 信号通路富集分析结果

3.4潜在靶点PPI 网络的构建与分析 STRING 数据库分析新橙皮苷治疗UC 的潜在靶点,构建获取50 个节点,172 条节点连接线的蛋白互作PPI 网络。Cytoscape 3.7.2 软件绘制PPI 网络图,节点平均度值为10.244 897 96,接近中心性平均值为0.515 360 558,介数中心度平均值为0.021 421 335。其中,有19 个节点度值>平均数,包括:丝裂原激活蛋白激酶14(MAPK14;p38)、白蛋白(ALB)、环状素受体1(ESR1)、纤维连接蛋白1(FN1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、环氧合酶2(PTGS2)、成纤维细胞生长因子2(FGF2)、干扰素(IFNG)、前列腺素-内过氧化物合酶2(PTGS2)、胱天蛋白酶1(CASP1)等,以上节点为新橙皮苷治疗UC 的核心靶点。见图6。

图6 新橙皮苷治疗UC 潜在靶点蛋白PPI 互作图

3.5不同剂量新橙皮苷对UC 小鼠体质量的影响 为进一步验证网络药理学的分析结果,本实验采用不同剂量新橙皮苷干预UC 模型小鼠,初步分析新橙皮苷的药效和作用机制。结果表明,与对照组相比,模型组在服用DSS 后体质量出现显著下降(P<0.05);然而与模型组相比,低、中、高剂量干预后,体质量都出现显著升高(P<0.05)。见图7。

图7 新橙皮苷干预对UC 小鼠体质量的影响

3.6不同剂量新橙皮苷对UC 小鼠DAI 评分的影响 5 组小鼠的DAI 评分显示,在第11 天时,对照组的小鼠DAI 评分为0;与对照组相比,模型组在服用DSS 后DAI 评分显著上升(P<0.05);与模型组相比,低、中、高剂量新橙皮苷干预都能显著降低DAI 评分(P<0.05)。见图8。

图8 新橙皮苷干预对UC 小鼠DAI 评分的影响

3.7不同剂量新橙皮苷对UC 小鼠结肠组织中pp38、p38 蛋白的影响 KEGG 富集到的关键通路MAPK 通路中重要组成部分p38(MAPK14)同样在的PPI 蛋白互作网络中富集到,结合图5 和图6 的分析结果,对排分靠前的MAPK 通路关键蛋白pp38 和p38 进行验证分析。结果显示:与对照组比较,模型组小鼠的结肠组织蛋白中p-p38 蛋白的表达水平显著升高(P<0.05),p38 蛋白表达水平差异无统计学意义(P>0.05)。与模型组比较,低、中、高剂量组小鼠结肠组织蛋白p-p38蛋白的表达水平均显著降低(P<0.05),p38 蛋白表达水平差异无统计学意义(P>0.05)。见图9—12。

图9 5 组结肠组织p-p38 蛋白阳性面积率比较

图10 5 组结肠组织p-p38 蛋白表达(×400)

图11 5 组结肠组织p38 蛋白表达(×400)

图12 5 组结肠组织p38 蛋白阳性面积率比较

4 讨 论

先前的研究发现,新橙皮苷可通过降低结肠组织中促炎因子TNF-α、IL-6、IL-1β 的表达水平来发挥其对UC 的保护作用[5]。本研究通过TCMSP、Swiss Target Prediction、TCMIP、SymMap、BATMANTCM 数据库进行新橙皮苷靶点的挖掘,并通过Dis-Genet 和GeneCards 数据库进行UC 靶点的挖掘,筛选并确定新橙皮苷可能作用于UC的潜在靶点51个。通过KEGG 通路分析,富集到MAPK 信号通路、IL-17 信号通路、化学致癌-活性氧通路等信号通路。MAPK 信号通路的激活主要涉及JNK、ERK 和p38的磷酸化,进一步激活细胞核中的转录信号从而在细胞增殖与分化、凋亡、调节炎症等生理和病理过程中发挥重要作用[12]。林雄[13]发现MAPK通路的激活可以促进NF-κB p65 的磷酸化,上调炎症细胞因子如TNF-α、IL-6 和IL-1β 的表达水平,通过苍术醇提物抑制MAPK 通路的激活可改善UC 症状。IL-17 是一种促炎因子,在多种细胞中都有表达,通过促进TNF-α、IL-6 等炎性因子的释放,发挥扩大炎症等功能[14]。马杰等[15]研究结果表明,黄芩多糖可通过抑制IL-17 的表达发挥对UC 的治疗作用。活性氧(reactive oxygen species,ROS)的过量累积导致细胞膜通透性增加,促进炎症反应[16]。研究发现在UC 肠道黏膜中会过量生成ROS,促进组织损伤[17]。这些研究进一步佐证了新橙皮苷可能通过调控MAPK 信号通路、IL-17 信号通路、活性氧相关通路来发挥其对溃疡性结肠炎的保护作用。

本研究通过构建新橙皮苷治疗UC 的潜在作用靶点PPI 网络图,发现MAPK14(p38)、CASP1、PTGS2 等靶点可能参与新橙皮苷治疗UC 的作用机制。陈赛等[18]研究证实白芍七物颗粒干预UC 小鼠,能降低p38 的磷酸化水平,通过阻断NOXs-ROS-p38 信号通路的传导,缓解UC 小鼠结肠组织的炎症反应;EPSTEIN 等[19]研究证实,姜黄素可通过阻断p38 MAPK 信号通路,减轻结肠黏膜组织的白细胞浸润,有效治疗DSS 诱导的UC 小鼠的结肠炎性病变。Caspase-1 是介导细胞焦亡所依赖的核心蛋白,它的激活是细胞焦亡经典途径的核心,属于免疫系统的重要组成部分[20]。研究表明,人炎性肠组织中Caspase-1 活化水平比正常肠组织中活化水平更高[21]。PTGS2 在调控免疫应答发挥重要作用,主要表达在单核细胞和肠上皮细胞中,在UC发展过程中对结肠黏膜愈合有促进作用[22]。这些研究提示新橙皮苷可能通过MAPK14(p38)、CASP1、PTGS2 等关键靶点的表达水平,调控相关免疫应答,治疗DSS 诱导的UC 小鼠的结肠炎性病变。

UC 的主要临床表现是腹痛、腹泻、黏液脓血便等,DSS 为经典的UC 造模方法,利用DAI 评分能反映该模型中UC 体质量下降、腹泻、黏液脓血便情况。本研究体内实验中DSS 造模后的UC 小鼠出现了明显的DAI 评分升高和体质量下降,而新橙皮苷可显著降低DSS 诱导的UC 小鼠体质量下降和DAI评分升高,结果表明新橙皮苷可缓解DSS 诱导的UC 小鼠的UC 体质量下降、腹泻、黏液脓血便症状。再以该模型验证网络药理学分析富集出的MAPK14(p38)关键靶点,通过体内实验的验证,可得出以下结果:在DSS 诱导的UC 小鼠模型中,新橙皮苷干预能够显著逆转模型组小鼠结肠组织中p38 蛋白磷酸化水平的升高,提示新橙皮苷对UC 的治疗作用可能是通过发挥对p38 MPAK 通路的抑制而实现。

综上,本研究通过网络药理学对新橙皮苷治疗UC 的相关分子机制进行探讨。采用体内实验对新橙皮苷调控p38 MPAK 信号通路,进而起到抑制UC 的发生、发展进行验证,为临床中研发防治UC的药物提供了有效的依据。不足之处在于,研究中仅对p38 MPAK 信号通路进行了探索验证,并未对该通路上下游相关通路蛋白进一步分析,计划在下一步的实验中进行探究。

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