王宁,刘昌伟,褚校涵,王晓甫,赵兴华,郝斌,许长宝

(郑州大学第二附属医院 泌尿外科,河南 郑州 453000)

肾细胞癌是泌尿系统致死率最高的恶性肿瘤,且发病率持续升高。乳头状肾细胞癌(papillary renal cell carcinoma,PRCC)是第二常见的肾细胞癌,占15%～20%[1]。根据病理学特征,PRCC可分为Ⅰ型和Ⅱ型。Ⅰ型PRCC的瘤体由管状及小核仁的乳头状嗜碱性细胞组成;Ⅱ型PRCC的瘤体则由大核仁的嗜酸性细胞组成。Ⅱ型PRCC细胞生物恶性度相对较高,常对应高T分期和差的核分级,易出现血管浸润或远处迁移,预后更差[2]。目前早期PRCC患者的首选治疗方式是手术治疗,晚期患者缺乏有效的治疗方法[3]。早发现、早治疗PRCC十分重要。本研究基于生物信息学挖掘PRCC生物标志物有助于诊断和预后评估,可为临床治疗提供新思路。

miRNA是一类内源性、非编码、单链小RNA,通过调控靶基因转录后表达参与一系列生物过程[4-5]。miRNA可通过正向或负向调控靶基因,发挥促癌或抑癌作用[6],也可参与肿瘤免疫识别以及免疫逃逸,引起免疫系统紊乱,进而影响癌症进展[7]。基于miRNA在癌症发生发展中的作用,miRNA作为癌症生物学标志物被广泛用于早期诊断及预后评估[8-9]。本研究通过生物信息学方法分析TCGA数据库中PRCC临床信息及miRNAs表达,旨在挖掘PRCC诊断和预后相关的miRNA生物标志物。

1 资料与方法

1.1 数据的获取与处理

从TCGA(https://portal.gdc.cancer.gov/)数据库下载326例样本miRNA表达数据(292例PRCC样本,34例正常样本)及匹配的临床数据(291例PRCC样本,34例正常样本),如年龄、性别、肿瘤分期、生存状态等(项目ID为TCGA-KIRP)。

1.2 差异表达miRNA筛选

利用R软件“edgeR”包筛选出……