王舸楠，李佳谦，李雨桐，陈世伟，王淑贤，赵廷彬，贾士儒，乔长晟,,

（1.天津科技大学生物工程学院，天津 300457；2.工业发酵微生物教育部重点实验室暨天津市工业微生物重点实验室，天津 300457；3.天津市微生物代谢与发酵过程控制技术工程中心，天津 300457；4 .天津慧智百川生物工程有限公司，天津 300457）

聚苹果酸（polymalic acid，PMLA）是以苹果酸为唯一单体的均聚高分子聚合物，属于聚酯类聚合物，具有高生物相容性、高水溶性、生物可吸收性、化学可衍生性、可降解性和无免疫原性等多种优良性能[1]。PMLA分子的侧链带有可修饰性较强的羧基，一些分子能够通过官能团反应引入其聚合链上，同时PMLA水解产生的苹果酸是理想的调酸剂，这使PMLA在生物医药、食品和生物材料领域具有潜在的应用前景[2-6]。

研究表明产黑色素短梗霉（Aureobasidium melanogenum）是一种具有较强产PMLA能力的类酵母真菌[4]，但目前对其PMLA生物合成研究并不透彻，对通路中关键酶的研究并不清晰。产量还有很大的提升空间[7]。同时，该菌基因组信息依旧较少，限制了该菌株的开发利用。因此，对该菌种进行基因组测序及组装可为改造菌种，提高产量提供理论依据。

目前，主流的基因测序分为两种，单分子测序（如Pacbio三代测序平台）和高通量测序（如二代Illumina平台），其中单分子测序具有读长长组装结果好的特点，但其测序成本与错误率较高；高通量测序采用双端测序策略，结果兼备质量高、价格低的特点，但其测序长度较短，组装会产生较多的片段（contigs）。因此采用三代测……