基于免疫信息学的SARS-CoV-2表位筛选及疫苗分子设计分析①
2022-07-21邓辉雄王革非李雁嫘宋鑫利谷李铭
邓辉雄 王革非 李雁嫘 宋鑫利 谷李铭 李 蕊
(汕头大学医学院微生物学与免疫学教研室,病原与免疫学研究中心,汕头 515041)
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染引起的新冠肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)疫情在全球200多个国家和地区流行,对全球公共卫生安全造成巨大威胁,给社会生活及经济发展造成巨大损失。我国与其他国家的科研人员针对SARS-CoV-2 的表征、候选抗原和表位的鉴定、动物模型的建立、免疫应答的表征以及疫苗设计研究取得了实质性进展[1-2]。截至2020年11月,至少已有5种SARS-CoV-2疫苗进入Ⅲ期临床试验。但SARS-CoV-2 的抗原特性、抗原变异对宿主的保护性免疫反应的影响有待进一步验证[2]。
利用免疫信息学筛选、分析鉴定具有免疫保护性的表位,可有效提高保护性抗体亲和力和细胞免疫平衡。病毒抗原,包括Spike 蛋白及RBD 区域存在多种表位。其中部分表位具有免疫保护作用,能够诱导中和抗体和抑制病毒复制的抗体,以及抑制或杀伤感染细胞及辅助免疫平衡应答的效应T 细胞。大多数表位所诱导的免疫应答不具有中和或抑制病毒复制的作用,反而可能会诱导细胞免疫应答失衡并加重炎症反应,存在免疫病理损伤、抗体依赖的感染增强(ADE)等负面风险,甚至可能减弱具有免疫保护力表位的免疫保护效应[3-4]。
Spike 蛋白是SARS-COV-2 的关键抗体靶点,其同源三聚体在受体结合和病毒入侵的过程中发挥重要作用。全长三聚体Spike 蛋白通常具有很高的免疫原性(约600 kD),其不仅包含RBD 及强效中和抗体的主要靶点,还包含能诱导中和抗体或保护性抗体的非RDB 区域,如N 端结构域。……
