2019-2020年宁夏炭疽芽胞杆菌毒力鉴定及基因分型研究
2022-06-08高建炜马江涛陈丽莉李小璐张术斌
杨 聪,高建炜,马江涛,海 娥,邹 悦,陈丽莉,李小璐,韩 坤,张术斌
炭疽是由炭疽芽胞杆菌引起的一种人兽共患传染病。主要传染源为牛、羊、马等食草动物,人因接触患病动物而被感染[1]。宁夏是炭疽自然疫源地,自2014年以来疫情呈现上升趋势,且疫源地面积较广,防控难度逐渐增大[2]。有研究发现炭疽芽胞杆菌的致病力与其毒力因子有关,当菌体中具有毒力因子即可判定为强毒菌株[3]。由于炭疽芽胞杆菌遗传进化相对保守,导致其基因缺乏遗传多样性,目前常用的基因分型技术主要有可变数目串联重复序列(multiple locus variable-number tandem repeat analysis, MLVA)和单核苷酸多态性(canonical single nucleotide polymorphism, canSNP)两种,对揭示菌株的遗传进化特征具有重要意义[4]。为了解宁夏炭疽芽胞杆菌的致病力和基因分型特征,揭示菌株间的遗传特征及基因型别,本研究对2019-2020年宁夏各地区分离到的炭疽芽胞杆菌进行了相关试验研究,以期为疫情溯源提供线索和科学依据。
1 材料与方法
1.1 菌株来源 本研究所用菌株为2019-2020年本实验室收集保存的临床分离菌株,共分离到4株炭疽芽胞杆菌,全部分离自患者皮肤渗出液(表1)。

表1 2019-2020年宁夏临床分离炭疽芽胞杆菌菌株信息Tab.1 Background information on strains of B. anthracis in Ningxia from 2019 to 2020
1.2 试验材料 Tag DNA聚合酶、无菌水、DNA Marker2000购自全式金生物有限公司;核酸提取试剂盒(QIAGEN DNA Mini Kit)购自德国QIAGEN公司;血琼脂平板、营养琼脂购自青岛海博生物有限公司。MLVA-15各位点引物由上海生工生物公司合成;SNP探针及引物由中国疾控中心传染病所提供;ABI7500Fast荧光定量PCR仪购自美国ABI公司。
1.3 方 法
1.3.1 菌株基因组DNA的提取 按照QIAGEN试剂盒步骤提取。……
