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不同膻味水平的龙陵黄山羊肝组织转录组SNP分析

2022-03-21王宣懿叶绍辉

湖北农业科学 2022年4期
关键词:水平

马 琳,杨 明,王宣懿,叶绍辉

(云南农业大学动物科学与技术学院,昆明 650201)

羊肉在世界各地广泛食用,但由于其膻味,在许多亚洲国家并不受欢迎。4-甲基辛酸(4-Methyl octanoic acid,MOA)、4-乙基辛酸(4-Ethyl octanoic acid,EOA)和4-甲基壬酸(4-Methyl Nonanoic acid,MNA)[1-3]这3 种化合物是引起羊肉膻味的主要物质,此外还有3-甲基吲哚(3-Methyl indole,MI)和4-甲基苯酚(4-Methyl phenol,MP)[4,5]。龙陵黄山羊(Longling yellow goat,LLG)是产于云南省保山市龙陵县及周边的地方品种,其具有体大、屠宰率高、耐粗饲等良种特性[6]。但膻味却一直制约着龙陵黄山羊的发展。羊的肝脏具有代谢功能,膻味物质的形成需要肝脏参与代谢,进而沉积到脂肪组织中,产生特有的羊膻味。目前龙陵黄山羊的研究主要集中在肉品质、养殖方式、繁殖性能和疾病的研究,鲜见其膻味研究的相关报道。

单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP),是指单个核苷酸的变异而导致的基因多态性,其数量很多,多态性丰富。每个SNP 位点都可以是4 种不同的变异形式(转换、颠换、插入、缺失),其中转换和颠换二者之比为2∶1,可能是因为CpG 二核苷酸中5-甲基胞嘧啶(5mC)脱氨基对胸腺嘧啶的高自发率而导致[7]。SNP 在CG 序列上出现最为频繁,是因为CG 中的C 常被甲基化而转换成T。SNP 位点极其丰富,几乎遍及整个基因组。虽然随着时空的改变转录基因种类可能会有些许变化,但转录组运用于检测转录区域多态性仍是1 种高效且经济的方法[8]。该研究旨在通过对龙陵黄山羊肝脏转录组SNP 进行分析,探索龙陵黄山羊膻味相关差异基因,为龙陵黄山羊膻味的相关研究提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 试验材料

选择饲养健康的龙陵黄山羊、云岭山羊(Yunling goat,YLG)和大理绵羊(Dali sheep,DLS)共14只;……

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