检测鸡传染性支气管炎病毒GVI-1基因型毒株的实时荧光定量PCR方法建立
2021-12-23陈淑琴杜旭彬张成成郭梦娇吴艳涛张小荣
陈淑琴,杜旭彬,鄢 坤,廖 凯,张成成,郭梦娇,吴艳涛,张小荣
(扬州大学 兽医学院 江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心,江苏 扬州 225009)
传染性支气管炎(infectious bronchitis,IB)是鸡的一种急性、病毒性疾病,主要侵害呼吸和泌尿生殖系统。该病在世界范围内广泛流行,给养鸡业带来了严重的经济损失[1]。传染性支气管炎病毒(infectious bronchitis virus,IBV)属于冠状病毒科冠状病毒属中的γ冠状病毒,极易发生遗传变异,导致新的基因型和血清型不断出现,使得病毒检测和免疫预防日益复杂化[2-3]。
2016年,VALASTRO等[4]基于对全球不同地区报道的1 518个IBV分离株S1基因序列系统发育分析的结果,提出了一种统一的IBV基因分型系统,将目前已知的IBV毒株分为6个基因型(GI~GVI)和32个进化谱系,其中GI基因型包括GI-1~GI-27等27个谱系,而GII~GVI每个基因型均只有1个谱系。研究表明,我国IBV流行情况较为复杂,且不同时期流行的优势基因型存在较大的差异,如GI-19型(也称QX型)即为当前流行的最优势的基因型(约占70%),此外还存在GI-7型(也称TWI型)和GVI-1(也称TC07-2型)等其他一些常见基因型[5]。其中GVI-1基因型(又称TC07-2型)IBV是最新出现的1种基因型,于2007年在广东首次分离鉴定,随后在亚洲其他一些国家相继出现[6-7]。流行病学监测结果显示近年来GVI-1基因型IBV毒株分离率呈持续上升趋势,尤其在我国南方地区的流行更为普遍,应当引起足够重视[8-9]。目前对分离株进行基因分型需要首先克隆S1基因并进行测序,然后通过基因序列比对和遗传进化分析确定对应的基因型,操作繁琐且周期较长。……
