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肾纤维化相关关键候选基因的生物信息学筛选*

2021-12-23杨洁珂李健春王人可樊均明

成都医学院学报 2021年6期
关键词:小鼠差异分析

杨洁珂,李健春,林 晓,王人可,樊均明,2,王 丽△

1.西南医科大学附属中医医院 中西医结合研究中心(泸州 646000); 2.成都医学院(成都 610500)

肾脏纤维化是多种慢性肾脏病(chronic kidney disease, CKD)的最终病理转归,也是CKD 进展为终末期肾病(end-stage renal disease, ESRD) 的关键环节。近年来,围绕肾纤维化发生的机制研究较多,包括发现其与炎症、巨噬细胞转分化和促纤维化通路(如TGF-β1/Smad3、Wnt/β-catenin等的异常活化有关[1-2],但确切机制尚不清楚。目前,临床上虽可采用血液净化手段缓解病情,但血透费用昂贵,给患者家庭带来沉重的经济负担,且血透只能暂时延缓病情,故对于抗肾纤维化方法的研究已成为关系国民健康及社会经济发展的重要议题[3]。

生物信息学是一个将计算和分析工具应用于捕获、分析和解释大量生物数据的全新科学领域。近年来,生物信息学分析在生命科学领域得到了广泛的应用,高通量测序可同时提供各实验组中数千个基因的表达水平,直接获取基因分子水平的信息。基于生物信息学的微阵列和高通量测序已被广泛用于预测各种疾病的潜在治疗靶点[4]。本研究拟采用生物信息学方法,对单侧输尿管梗阻(unilateral ureteral obstruction, UUO) 小鼠模型的基因表达谱数据进行分析,同时构建UUO 3 d急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)和UUO 7 d CKD模型,并验证生物信息分析筛选出的与肾纤维化相关的核心基因,以期建立一种基于生物信息学分析筛选肾纤维化关键候选基因的方法,为CKD发病机制和抗纤维化治疗靶点的研究提供新思路。

1 材料与方法

1.1 主要仪器与试剂

仪器:Light CyclerR480Ⅱ PCR仪(Roche,瑞士);……

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