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斑马鱼丝氨酸羟甲基转移酶1基因的生物信息学和表达分析*

2021-12-23陈炳宇夏佳敏黄四洲

成都医学院学报 2021年6期
关键词:小鼠

陈炳宇,何 兴,夏佳敏,邹 蓉,黄四洲△

1.成都医学院 人体解剖与组织胚胎学教研室(成都 610500);2.发育与再生四川省重点实验室(成都 610500);3.成都医学院 生物医学院(成都 610500)

斑马鱼是一种淡水硬骨鱼,自20世纪70年代有学者[1]使用斑马鱼作为模型生物以来,越来越多的实验室开始使用这种模型生物作为疾病研究对象。由于斑马鱼的基因组与人类有70%的相似[2],每次交配都会产生大量胚胎,且胚胎透明,有利于观察研究。因此斑马鱼已成为用于大规模筛查临床药物的理想模型,同时该模型生物也在发育与再生等研究方面具有很好的运用前景。

丝氨酸羟甲基转移酶(shmt)是调节一碳代谢中叶酸循环的关键蛋白,其家族包含细胞质同工酶(shmt1)和线粒体同工酶(shmt2)两种[3]。shmt1能催化将丝氨酸和四氢叶酸转化为甘氨酸和5,10-亚甲基四氢叶酸[4-6],并为核苷酸合成提供了单碳单元,影响DNA甲基化状态和NADH/NADPH的产生[7-8]。2008年,研究者[9]发现,敲除shmt1蛋白表达的小鼠是可育的,随后发现低叶酸饮食喂养的该突变体小鼠神经管缺陷的发生率增加[10],但shmt1基因在胚胎发育中的具体作用及调控机制尚未阐明。

研究[11]表明,细胞代谢相关的调控基因已成为新的癌症诊断标记和治疗靶点,其中一碳代谢对于细胞代谢必不可少。在一碳代谢途径叶酸循环、蛋氨酸循环和反硫化途径3个关键反应的叶酸循环中,叶酸及叶酸循环中间产物可以通过产生嘌呤和胸苷酸来调控癌症细胞的生长和增殖[9]。根据2019年公共数据库的数据挖掘和临床标本的验证实验[12]结果显示,shmt1在肝细胞性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达明显降低,并且与HCC患者的不良临床特征和不良预后相关。……

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