CDH13基因在转移性肾透明细胞癌中的研究*
2021-12-20周晓慧王怡方周晓莹
郑 倩,周晓慧,王怡方,周晓莹
(广西医科大学生命科学研究院,南宁 530021)
肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是泌尿系统中最常见的恶性肿瘤之一[1]。RCC可分为肾透明细胞癌(kidney clear cell carcinoma,KIRC)、肾乳头状细胞癌(kidney papillary cell carcinoma,KICH)和肾嫌色细胞癌(kidney chromophobe,KIRP)等亚型,其中以KIRC 最为常见,占肾细胞癌死亡人数75%[2]。局部肾细胞癌可以通过肾切除和立体定向消融放疗来治疗,但是仍有30%的患者最终发生转移,其中KIRC 在转移性肾癌中占83%~88%。尽管基 于VEGF(vascular endothelial growth factor,VEGF)和雷帕霉素(mamalian target of rapamycin,MTOR)等分子靶向药物已经应用于肾细胞癌的临床治疗,但是对于大多数具有远处转移患者的效果却微乎其微[3-4]。因此,找寻新的肾细胞癌生物分子标志物对于疾病诊断、预后的判断、制定精准的治疗方案具有重要的意义。
CDH13基因位于染色体16q14.2-3,编码T-钙粘蛋白(T-cadherin,T-cad),是钙粘蛋白家族的成员之一。越来越多的研究表明,T-cad的下调与肿瘤的侵袭和转移有关,如胃癌、膀胱癌、前列腺癌等,推测T-cad 可能是一种肿瘤转移抑制因子[5-7],但在KIRC中的研究尚未见报道。本文主要探索CDH13 在KIRC中的转录、蛋白表达改变和调控机制,及其作为预后标志物的价值,以期为临床治疗KIRC 提供实验依据。
1 材料与方法
1.1 TCGA 数据库 利用UCSC Xena 数据库(https://xena.ucsc.edu/)下载TCGA 数据库分析533例KIRC组织和72例正常肾组织RNA-Seq数据,分析CDH13 在KIRC 中的转录水平及与患者临床病例特征之间的相关性。
1.2 GEO数据库 从NCBI中的GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/)搜索KIRC 相关的表达谱芯片,纳入标准:(1)至少包含KIRC 组织和非癌组织各3 例;(2)来源物种为人类;(3)包含CDH13的数据,由此共纳入13套表达谱芯片,包含476 例KIRC 组织和312 例正常肾组织,对CDH13 mRNA转录水平进行Meta分析。……
