基于生物信息学分析ESPL1基因在肺腺癌中表达与突变的临床意义
2021-12-16柳家翠黄奔程庆元蔡伟国段怡平陈梁玥马甜甜朱翠雯喻明霞
柳家翠 黄奔 程庆元 蔡伟国 段怡平 陈梁玥 马甜甜 朱翠雯 喻明霞★
作者单位:1.武汉大学中南医院基因诊断中心,湖北,武汉430071
2.武汉大学中南医院影像科,湖北,武汉430071
肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LUAD)是肺癌主要的组织学类型[1]。肺癌患者五年生存率仅为15%,尽管治疗取得一定进展,但生存率仅小幅提升[2]。因此,深入认识肺癌分子发病机制,寻求有效的新型标志物进行分子靶向治疗,对改善肺癌患者的总体生存期具有重要意义。外纺锤体极样蛋白1(Extra spindle poles-like 1 protein,ESPL1)具有半胱氨酸型内肽酶活性,其编码的分离酶在染色体分离和细胞分裂过程中发挥重要作用[3]。分离酶的功能是在有丝分裂后期开始时裂解黏附素,从而释放黏附的姐妹染色单体。分离酶还参与DNA 损伤修复、膜运输等多种基本生物功能[4]。ESPL1表达受到严格调控以确保许多重要细胞生物学活动的正常运行。由于其在细胞周期和DNA 损伤修复中的重要性,ESPL1的表达异常或突变极可能与恶性肿瘤的发生发展有关。研究发现,ESPL1在乳腺癌[5]、前列腺癌[6]、子宫内膜癌[7]等肿瘤中异常表达,并影响患者预后。但是该分子在肺腺癌中的表达与临床相关性还未有讨论。因此,本研究利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的肺腺癌样本数据,探索ESPL1在肺腺癌中的表达、突变及预后价值,并预测ESPL1在肺腺癌发生发展中的分子作用机制。
1 材料与方法
1.1 原始数据的下载及预处理
检索并下载来自TCGA 官网(https://portal.gdc.cancer.gov/)的肺腺癌(LUAD)的表达谱数据(535 例肿瘤组织样本,59 例正常组织样本)及相应临床信息。……
