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不同产蛋期蛋鸡卵巢组织差异表达基因的筛选与鉴定

2021-12-05段晓燕

家畜生态学报 2021年11期
关键词:途径分析研究

段晓燕,刘 宇

(1.河北北方学院 教务处,河北 张家口 075000 2.河北北方学院实验动物中心,河北 张家口 075000)

卵巢是蛋鸡重要的生殖器官和内分泌腺,其发育程度直接关系着蛋鸡产蛋性能的优劣。随年龄变化,蛋鸡卵巢状况与产蛋性能直接相关[1]。同时,每个卵泡由卵泡卵囊层、颗粒层和卵母细胞周围的基质组成,而卵泡细胞的结构和数量在卵巢发育阶段有显著差异。研究发现,在不同产蛋周期,蛋鸡在经历了密集的新陈代谢后,不同组织与某些功能分子表达量的改变有关[2-3]。因此,筛选不同生长发育阶段蛋鸡卵巢组织的DEGs能够从分子层面帮助研究人员蛋鸡卵巢组织特征,进而能够分析影响蛋鸡繁殖性能的关键调节基因。 转录组学因其高通量、高灵敏性的优势可用来获取某物种细胞或组织的完整转录组数据,可以分析物种在不同条件下的基因表达变化[4]。基于此,本研究利用RNA-seq分析不同产蛋周期蛋鸡卵巢组织DEGs,以期为蛋鸡分子育种提供新的理论资料。

1 材料与方法

1.1 样品采集与文库构建

本研究以张家口地区饲养的京红蛋鸡为研究对象。100只蛋鸡按照标准饲养管理程序饲养,分别于5月龄(产蛋初期,产蛋率46%,LH_5M),6月龄(产蛋高峰期,产蛋率93%,LH_6M)采集蛋鸡卵巢组织(各组n=3)。样品采集至无RNA酶EP管后立即投入液氮,运回实验室用于总RNA提取。总RNA采用trizol一步法提取,提取后采用Nanodrop检测浓度,以RIN值大于7作为提取成功的标准。选取10 μg检测合格的RNA,采用Epicentre Ribo-Zero Gold Kit (Illumina, San Diego, USA)去除核糖体RNA(rRNA)后随机打断为小片段,利用逆转录法合成cDNA文库,平均双末端文库长度为(300±50)bp。……

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