宏基因组学技术在痤疮研究中的应用进展
2021-12-01李伟王冲刘嗣嘉杨敏一张云平
生物技术进展 2021年6期
关键词:研究
李伟,王冲,刘嗣嘉,杨敏一,张云平
1.聊城大学东昌学院化学与生物系,山东 聊城252000;
2.聊城市人民医院皮肤科,山东 聊城252000;
3.香港浸会大学理学院,香港999077
皮肤覆盖于人体的表面,是人体最大的器官,皮肤微生物组是一个多样化的生态系统,通过调节皮肤的微生物组成和免疫系统功能影响皮肤的健康状况。皮肤微生物组因身体部位、年龄、地域和疾病等因素而存在差异,且还会受到环境、护肤品和药物等因素的影响。研究表明,皮肤微生物组是健康皮肤环境必不可少的组成部分,微生物群落组成的改变可能导致皮肤失去平衡,进而引起皮肤疾病[1−2]。痤疮作为最常见的皮肤病之一,影响全球约85%的青少年。痤疮是免疫介导的慢性炎症性毛囊皮脂腺单位的疾病,与多种因素有关,虽然尚不清楚其病因,但研究表明皮肤微生物及其变化在痤疮的发病机理中具有重要作用[3]。
早期人们研究微生物物种及其相互作用主要通过体外培养的方法,这种基于菌株水平的传统分离培养技术可以帮助人们认识微生物的多样性。然而许多微生物是无法经体外培养的,不同微生物的生长速度及其对培养条件的要求也存在差异,使得培养分离耗时较长且不能全面挖掘微生物的多样性[4−5]。高通量测序技术(high-throughput sequencing)的出现和发展有效地解决了这一问题,尤其是近年来发展迅速的宏基因组学技术,利用现代基因技术对样品中的大量基因进行测序,无需分离单个物种,这使得人们能够对微生物组的多样性进行深入探索,并对微生物暗物质进行表征[4],该方法不仅可以更全面地鉴定皮肤上的微生物种类,还可以揭示微生物在转录组水平上对特定刺激的反应。……
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