小麦粒形QTL元分析及候选基因预测
2021-12-01张沛沛王彩香程宏波杨德龙
王 鹏,田 甜,张沛沛,刘 媛,陈 涛,王彩香,程宏波,杨德龙
(1.甘肃省干旱生境作物学重点实验室,甘肃兰州 730070;2.甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州 730070)
籽粒长度和宽度决定小麦(Triticumaestivum)种子的大小,进而影响小麦的产量和品质,是小麦育种中的重要农艺性状[1]。研究表明,小麦的粒长和粒宽是典型的数量性状,由多基因控制,其遗传基础复杂,易受环境因素的影响[2]。目前,QTL定位是深入研究复杂数量性状遗传基础的有效方法之一,已广泛应用于作物农艺性状遗传解析[3]。许多研究者利用不同遗传背景材料和遗传图谱,对小麦粒长和粒宽进行了QTL定位和遗传分析。Ramya等[4]以Rye Selection 111×中国春构建的RIL群体,检测到8个控制粒长的QTL和15个控制粒宽的QTL,分布在1A、1D、2B、2D、4B、5A、5B和5D染色体上,单个QTL可解释4.4%~11.5%的表型变异。Kumari等[5]以NW1014×HUW468构建的RIL群体,在4A和5A染色体上检测到2个控制粒长的QTL,在6A和7D染色体上检测到2个控制粒宽的QTL,单个QTL可解释7.66%~53.84%的表型变异。Xie等[6]以面包小麦×Spelt构建的RIL群体,在1D、2A、3B、4A、5A和7B染色体上检测到8个控制粒长的QTL;在2D和5A染色体上检测到2个控制粒宽的QTL,单个QTL可解释6.6%~31.8%的表型变异。然而,由于群体材料遗传背景、统计方法、标记类型和环境条件的不同,导致定位到的控制小麦粒长和粒宽的QTL数目、染色体位置和遗传效应差异较大,难以获得真实、稳定的QTL区段和位点,无法直接在育种实践中应用。因此,通过整合QTL,可提高小麦粒长和粒宽定位的精确度。
元分析是一种整合前人研究数据的统计分析方法,应用于动、植物的QTL整合分析。……
