基于全基因组测序筛选腰椎管狭窄症易感基因突变位点
2021-12-01SuriP,StanawayIB,ZhangY等
中国疼痛医学杂志 2021年7期
腰痛 (low back pain, LBP) 是美国公民就医的第五大病因,也是致残的主要原因。LBP 发病率高,社会影响大,但病因尚未明确。有效识别LBP 的遗传易感因素将是探索发病机制和探究新疗法的一种有效途径。LBP 的广义遗传力高达40%,显示其与遗传因素密切相关。基于两项全基因组关联分析(GWAS)数据确定了LBP 相关易感基因突变位点,表明遗传因素是LBP 的生物-心理-社会模式的基础,开启了LBP 遗传机制研究的大门。在医学上LBP作为一种临床症状,而非一项诊断。临床上被普遍接受的两种常用诊断分别为腰骶神经根性疼痛或腰骶神经根综合征(LSRS)和腰椎管狭窄症 (LSS),其他诊断缺乏诊断标准。因此,LBP 的研究多集中在“非特异性(原发性)腰痛”方向,并未考虑潜在的外周致病因素,忽略了与LBP 相关疾病的表型异质性可能会降低通过GWAS 探索致病基因统计学效力。临床上也可通过疾病特定的“内在表型”进行诊断,例如公认的LSRS 和LSS 临床综合征。通常在病人自诉不清的情况下可在规范化临床诊疗中通过电子病历 (EHR) 关联的遗传生物库数据进行诊断。该遗传生物数据库可提供病人及受试者较为全面的病史,进而实现更准确的疼痛表型分型。
本项研究中,利用EHR 生物库数据资源探讨了LBP 和腰椎疾病的潜在遗传学发病机制。首次发现LBP 相关易感基因突变位点,同时确定与LSRS和LSS 相关的易感基因突变位点,最后利用EHR生物库数据进行GWAS 分析确定了LBP 和腰椎疾病相关的易感基因突变位点的表现型。
1. 研究方法
(1)概述:GWAS 被称为“不可预知的”或“没有假设的”基因筛选方法。……
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