猪肠道冠状病毒检测技术研究进展
2021-11-30王亚楠姜金庆范国英李任峰王自良
韩 笑,王亚楠,姜金庆,范国英,李任峰,王自良
(河南科技学院 动物科技学院,河南 新乡 453003)
猪肠道冠状病毒(swine enteric coronavirus,SECoV)属于SECoV属于尼多病毒目(Nidovirales)、冠状病毒科(Coronaviridae)、冠状病毒属(Coronavirus),是有囊膜的单股正链RNA病毒。病毒表面有棒状突起,形似“日冕”或皇冠状,大小为70~200 nm[1]。SECoV基因组含有5’端的帽子结构和3’端的Poly(A)结构,编码四种主要结构蛋白,即纤突蛋白(Spike, S)、核衣壳蛋白(Nucleocapsid, N)、膜蛋白(Membrane, M)、包膜蛋白(Envelope, E)[2-5]。由于其RNA具有较高的重组频率,导致病毒结构不稳定,容易变异。目前已知的SECoV主要包括猪传染性胃肠炎病毒(transmissible gastrogenteritis virus,TGEV)、猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)、猪德尔塔冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)以及猪急性腹泻综合征冠状病毒(swine acute diarrhea syndrome coronavirus,SADS-CoV)[6-8]。
近年来,SECoV的流行与进化越来越复杂,毒株间和毒株内重组现象加剧,防控形势依然严峻[9]。本文就目前SECoV的核酸和免疫学检测方法进行综述,旨在为SECoV的防控提供参考依据。
1 核酸检测技术
1.1 聚合酶链式反应
聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)是一种通过体外扩增病原特定DNA序列从而对疾病进行诊断的分子生物学技术。该技术诞生于1985年,经过不断改进已衍生出多种体外扩增方法。Ding等[10]基于TGEV、PEDV和PDCoV的N基因、猪A型轮状病毒(porcine rotavirus A,PRoV-A)VP7基因以及猪库布病毒(porcine kobuvirus,PKV)和猪萨博病毒(porcine sapovirus,PSaV)的多聚蛋白基因建立了多重逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)检测方法,该方法能同时检测TGEV、PEDV、PDCoV、PRoV、PKV和PSaV六种猪肠道病毒,与猪的其他病原之间无交叉反应。随着技术的不断进步,荧光定量PCR(quantitative PCR,qPCR)的出现解决了普通PCR技术存在的难以定量、变异系数较大等问题。Pan等[11]针对PEDV、猪环曲病毒(porcine torovirus,PToV)和SADS-CoV的ORF1a区域以及PDCoV的ORF1b区域设计特异性引物和TaqMan荧光探针,建立了能够同时检测PEDV、PDCoV、SADS-CoV三种猪冠状病毒和PToV的RT-qPCR方法,该方法的灵敏度可以达到100拷贝/μl。……
