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基于网络药理学和分子对接研究金线莲的主要功效

2021-11-15林仁义杨丽娟俞晓玲黄丽英

福建医科大学学报 2021年3期
关键词:数据库

林仁义, 杨丽娟, 俞晓玲, 黄丽英

网络药理学是英国药理学家Hopkins于2007年首次提出的[1],它强调疾病的发生发展是一个长期、复杂的动态过程,复杂的生物网络失衡才是疾病的本质,即生物网络中的基因或者其产物等多个靶点处于功能失衡的状态[2]。从多成分、多靶点的研究思路出发,将药物-靶点网络与生物系统网络相结合,为新药的研发提供新的方向,且当今多靶点药物的研发也正逐渐成为一种新趋势[3-4]。单靶点药物在治疗多因素疾病如肿瘤、心血管系统、内分泌系统疾病时,往往难以达到预期效果,还可能引发毒副作用[5]。中药及其复方的活性成分复杂多样,能更好地发挥“多成分、多靶点、多通路”的协同作用,体现出整体治疗的优势。

金线莲[Anoectochilusroxburghii(Wall.) Lindl. (A.roxburghii)]是兰科开唇兰属多年生草本药用植物,素有“金草”“神草”“药之王”“鸟人参”等美誉,全草入药,具有清热凉血、解毒消肿、润肺止咳等功效,广泛用于治疗肝炎、糖尿病、肿瘤等疾病[6]。本研究通过筛选金线莲的主要活性成分和靶点,并挖掘核心靶点,旨在进一步系统地阐述金线莲的药用功效。

1 材料与方法

1.1 活性成分的收集与筛选 通过文献检索收集金线莲的活性成分,利用PubChem (https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)有机小分子生物活性数据库对每个活性成分的结构进行确认,下载保存每个活性成分的三维(3D)结构,文件保存格式为“.sdf”。将文件导入Swiss ADME (http://www.swissadme.ch/) 平台,获取每个活性成分的SMILES号,点击Run查看运行结果。根据胃肠道吸收(gastrointestinal absorption,GI absorption)的高低指示口服生物利用度[7]、通过类药性指标筛选出具有良好药代动力学性质的活性成分。……

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