APP下载

鸡胸肌条纹/木质表型相关基因的筛选

2021-11-09樊庆灿郑路程王倩倩郑文亚

中国畜牧杂志 2021年9期
关键词:差异信号分析

樊庆灿,郑路程,王倩倩,刘 犇,2,杨 雪,胡 威,2,郑文亚

(1.宜春学院生命科学与资源环境学院,江西宜春 336000;2.江西绿科农牧科技有限公司,江西宜春 336000)

过去几年中,快大型肉鸡的胸肌中白条纹肉(White Striping,WS)和木质肉(Woody Breast,WB)异常表型不断上升。WS 存在数量不等的与肌纤维平行的白色条纹[1]。WB 呈木质化,发病严重的肌肉表面可同时出现白色条纹和弥漫分布的脊状突起[2],严重影响鸡肉的屠宰外观和肉品质。WS 和WB 表型有所不同,但肌肉组织均有所损伤。组织学评估表明,异常样品均呈现肌肉表层的退化,包括纤维坏死和溶解、异常纤维化和脂质增多[3]。为了阐明WS/WB 表型发展的分子机制,Zambonelli 等[4]比较了的Ross 708 肉鸡WS/WB胸肌和正常胸肌基因表达模式,鉴定出的差异表达基因(DEG)与肌肉发育、炎症、多糖代谢和钙信号传导有关。Malila 等[5]则筛选出钙信号传导和Ras 相关蛋白1信号传导等8 个信号通路与WS/WB 的产生有关,并发现细胞内Ca2+等离子、氧化应激和细胞程序性死亡引起WS/WB 表型。本研究利用GEO2R 软件的相同标准分别分析2 组表达谱数据,统计快大型肉鸡正常肌肉表型和WS/WB 肌肉表型的差异表达基因,以进行共同基因分析,并对筛选到的共同基因进行功能注释和功能富集分析,探讨WS/WB 肌肉表型的发生机理,为鸡屠宰和肉质性状的研究提供参考。

1 材料和方法

1.1 数据及样本 本研究数据来自于美国国家生物信息数据库中的GEO 数据库,编号分别为GSE79276 和GSE107362,2 个数据系列的实验动物分别为罗斯708和罗斯308 的公鸡,屠宰日龄均为49 d,样品均为胸大肌,样品表达量检测分别采用GPL21385 和GPL24307平台。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

差异信号分析
相似与差异
信号
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
完形填空二则
找句子差异
电力系统不平衡分析
生物为什么会有差异?
基于FPGA的多功能信号发生器的设计
电力系统及其自动化发展趋势分析
基于LabVIEW的力加载信号采集与PID控制