利用TCGA数据集分析E2F7在肺腺癌中的表达及临床意义
2021-10-29赵秋荣陈良远
赵秋荣 郭 静 陈良远▲
1.福建省立医院检验科,福建福州 350001;2.福建省龙岩市第三医院检验科,福建龙岩 364000
肺癌是目前全球最常见的恶性肿瘤之一。男性肺癌新发病例及死亡率居所有恶性肿瘤第1 位。女性肺癌新发病例居第3 位,死亡率居第2 位[1]。肺腺癌是一种恶性上皮肿瘤,有腺样分化和黏液分泌两种类型,目前已成为最常见的肺癌病理类型[2-3]。
E2F 家族的转录因子成员在各种肿瘤中表达,在增殖、分化、凋亡和肿瘤生成中具有作用;此外,其异常激活和调节与肿瘤发育和预后不良有关[4-6]。E2F 系列有8 个成员,称为E2F1+8,充当转录活化剂(E2F1+3)或抑制器(E2F4+8)[7]。它们在正常组织中以低水平表达,但在肿瘤组织中表达过度,成为具有吸引力的潜在治疗靶点[6-8]。在肺腺癌中E2F 家族的研究较少,目前就E2F1 有相关报道[9]。鉴于此情况,本研究通过癌症基因组图谱公共数据集(the cancer genome stlas,TCGA)下载肺腺癌组织及癌旁组织E2F7 蛋白表达量的数据,研究E2F7 在肺腺癌中的表达及其相关病理特征的关系,以探讨其在肿瘤发生发展中的作用机制,为临床提供参考。
1 材料与方法
1.1 TCGA 数据下载
在TCGA(https://cancergenome.nih.gov/)搜索并下载数据库中肺腺癌相关RNAseq 数据,在排除缺失生存资料和临床参数的病例后,共纳入337 例肺腺癌组织(肿瘤组)与59 例癌旁组织(癌旁对照组)的RNAseq 数据及对应的肺腺癌患者临床数据。
1.2 对E2F7 表达与临床预后的关系进行分析
利用已有数据,分析在总体337 例肺腺癌(肿瘤组)和59 例癌旁组织(癌旁对照组)中E2F7 的表达差异。利用COX 逻辑回归分析评估肺癌患者预后的独立危险因数。……
