黔北麻羊PPP3CA基因克隆、生物信息学分析及不同组织表达研究
2021-10-21惠茂茂周志楠
惠茂茂,陈 祥*,敖 叶,周志楠
(1.贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025;2.贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025)
黔北麻羊作为贵州省三大山羊品种之一,其在生态学特征、体质外貌特征、生理指标、生产性能、繁殖性能等方面均具有诸多特点[1],尤其在肉质优良特性方面具有较高的开发价值[2]。羊肉肉质细嫩、营养丰富,深受消费者喜爱[3]。羊骨骼肌是主要食用部分,占机体干重的40%~50%[4]。肌纤维是构成动物骨骼肌组织的基本单元,是肌肉生长的重要参数。钙调磷酸酶是影响肌纤维的重要信号分子。蛋白磷酸酶3(Protein Phosphatase 3,PPP3)又称钙调磷酸酶(Calcineurin,CaN)是受Ca2+/ 钙调素(Calmodulin,CaM)调节的丝/苏氨酸蛋白磷酸酶,由1 个催化亚单位(PPP3 Catalytic Subunit,PPP3C)和1 个调节亚单位(PPP3 Regulatory Subunit,PPP3R)组成的异源二聚体[5-6]。在脊椎动物中PPP3C有PPP3CA、PPP3CB和PPP3CC3 个亚单位,其中PPP3CA 和PPP3CB 在机体内分布广泛[7-9],PPP3CA在脑和心血管系统中分布最多。在骨骼肌中,PPP3参与成肌细胞分化、成熟肌纤维肥大和响应细胞内钙浓度变化的纤维类型转换的调节。有研究表明,PPP3CA基因是小鼠几乎所有类型骨骼肌的主要催化亚型[10]。此外,PPP3CA基因在天府山羊的股二头肌、长肌和腹肌中也具有较高水平的表达[11]。迄今为止PPP3CA基因已在人[12]、小鼠[13]、猪[14]和牛[15]等多种动物中克隆并发现其编码的蛋白高度保守,关于黔北麻羊的报道较少。因此,本实验以黔北麻羊为研究对象,以PPP3CA为候选基因,克隆获得黔北麻羊PPP3CA基因编码序列进行生物信息学分析,运用实时荧光定量PCR 建立黔北麻羊PPP3CA基因的组织表达图谱,为研究PPP3CA基因的生物信息学功能机理提供参考作用。……
