苏孟园,杨汶珊,唐荣叶,徐杰杰,王 涛,尹绍武

(1.南京师范大学海洋科学与工程学院,江苏 南京 210023)(2.江苏省特色水产育种与绿色高效养殖技术工程研究中心,江苏 南京 210023)

微卫星(microsatellite)是指以1～6个碱基为基本单位重复串联组成的DNA序列[1],在真核、原核生物以及病毒基因组中均广泛分布[2-3]. 微卫星具有共显性遗传、多态性信息丰富和易于检测等特点,在物种保护[4-5]、种质资源评价[6]、种群遗传多样性研究[7-12]、亲缘关系鉴定[13]及物种鉴定[14]等方面的应用越来越广泛.

花斑无须鲶(Ageneiosusmarmoratus)隶属于脊椎动物亚门(Vertebrata)、辐鳍鱼纲(Actinopterygii)、鲇形目(Siluriformes)、项鳍鲶科(Auchenipteridae)、无须鲶属(Ageneiosus),主要分布于南美洲秘鲁、阿根廷、圭亚那、厄瓜多尔以及苏里南淡水流域的底层水域,适宜的水体pH为6.5,适宜温度为23～26 ℃,体长可达18.5 cm,可作为观赏鱼类[15]. 与鲶鱼类大多具有发达的须不同,花斑无须鲶的两颌无须,是在基因组水平上研究胡须形成发展机制并以此揭示脊椎动物生理学重要过程的一个理想的自然模型,目前以花斑无须鲶为模型在无须机制这一方面的研究已取得了一定的进展[16]. 保护、开发花斑无须鲶遗传资源并对花斑无须鲶基因组进行进一步的研究有重要意义.

目前国内外对于花斑无须鲶这一物种的研究相对较少,对于花斑无须鲶遗传资源的保护重视程度不够. 迄今为止,花斑无须鲶微卫星相关的研究尚未见报道. 本研究根据NCBI已公布的花斑无须鲶全基因组序列,利用生物信息学软件对花斑无须鲶全基因组微……