杨生海，刘西兰，张 勇

(1.甘肃农业大学 动物医学院，甘肃 兰州 730070； 2.中农威特生物科技股份有限公司，甘肃 兰州 730046)

口蹄疫(foot-and-mouth disease，FMD)是一种在偶蹄动物间常见的具有急性、热性、高度接触性传染的病毒性疾病，易感动物达70多种，包括牛、羊、猪、鹿、骆驼等其他偶蹄动物，一旦暴发，就会迅速在易感动物之间传播，引发大范围疫情，造成暴发疫情地区的重大经济损失，被世界动物卫生组织(OIE)列为A类动物疫病之首[1]。口蹄疫病毒(FMDV)有 O、A、C、SAT1、SAT2、SAT3、AsiaⅠ型7个血清型，每个血清型又包含若干血清亚型。该病毒不仅在各血清型之间无交叉免疫性，相同血清型的各亚型之间也仅有部分交叉免疫性[2]。

FMDV由衣壳蛋白包裹着包含约8 500个核苷酸的单链RNA组成[3]。FMDV单股正链RNA包括5′非编码区(5′-UTR)，一个开放阅读框(ORF)以及 3′-UTR。ORF编码一种多聚蛋白，被病毒和细胞的蛋白酶切割，产生构成病毒衣壳的成熟结构蛋白及复制依赖的非结构蛋白[4]。ORF根据其不同的功能被区分为4个功能区域：L、P1、P2 和P3，其中L区域编码Lpro蛋白，该蛋白可水解自身多聚蛋白[5]；P1区域编码衣壳蛋白，经蛋白酶分解后得到组成衣壳的成熟蛋白，包含VP1、VP2、VP3和VP4，VP2与VP4是VP0水解得到的；P2和P3区域分别编码2A、2B、2C蛋白以及3A、3B、3Cpro、3Dpol蛋白，整个病毒衣壳由60个原聚体构成，这60个原聚体在细胞内组装成一个二十面体的衣壳，衣壳直径大约30 nm[6-7]。但目前涉及FMDV持续感染的机制仍不清楚[8-9]，因此，了解FMDV感染的分子机制，对寻找分子靶标和研发新型高效疫苗具有重要意义。

本研究采用生物信息学方法，通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)，筛选可能与FMDV 感染相关的通路及生物学功能。……