肠杆菌科细菌对氨基糖苷类的耐药性及16S rRNA甲基化酶基因的检测研究
2021-09-30王文,王亮,陶佳,李刚,贾伟
王 文, 王 亮, 陶 佳, 李 刚, 贾 伟
当前革兰阴性杆菌的耐药性日趋严重,尤其是多重耐药和泛耐药菌株的出现已成为全球关注的焦点。氨基糖苷类抗菌药物因其抗菌谱广、抗菌活性强,被用于抗耐药革兰阴性菌感染的临床治疗,尤其是肠杆菌科细菌所致的感染,已经成为联合用药的重要选择之一[1]。但16S rRNA甲基化酶的出现和扩散,导致了细菌对氨基糖苷类抗菌药物高水平耐药,影响了其临床抗感染治疗。本研究对宁夏医科大学总医院2017年分离的氨基糖苷类耐药肠杆菌科细菌的16S rRNA甲基化酶基因进行筛查,并对耐药情况进行研究。
1 材料与方法
1.1 菌株来源
收集我院2017年1月1日—12月31日临床诊断为各种包括呼吸道、腹腔、尿路、血流和皮肤软组织等感染分离的非重复肠杆菌科细菌142株,其中包含对阿米卡星耐药的肠杆菌科细菌72株(大肠埃希菌37株、肺炎克雷伯菌35株),对阿米卡星敏感的肠杆菌科细菌70株(大肠埃希菌32株、肺炎克雷伯菌38株),称为氨基糖苷类耐药/敏感肠杆菌科细菌。质控菌株为大肠埃希菌ATCC 25922,铜绿假单胞菌ATCC 27853,购自上海汉尼生物技术有限公司。
1.2 仪器和试剂
采用法国生物梅里埃全自动细菌分析仪VITEK 2-Compact对细菌进行鉴定,仪器配套药敏卡GN04初筛阿米卡星耐药(MIC≥64 mg/L),肉汤微量稀释法进行药敏复核,按照2017年美国临床和实验室标准化协会(CLSI)标准判断结果。
1.3 基因扩增和测序
将142株细菌分纯培养后,用煮沸法提取细菌DNA[2]。取1 μL提取物做模板,对16S rRNA甲基化酶基因(armA、rmtA、rmtB、rmtC、rmtD、rmtE、rmtF、rmtG、rmtH、npmA) 进 行 PCR扩增,将阳性扩增产物送上海生工生物工程有限公司进行测序,所得序列用BLAST软件(https:www.ncbi.nlm.nih.gov/)分别进行比对。……
