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功能MRI时间分辨率对基于格兰杰因果模型的脑效应连接的影响

2021-09-27张欣欣杨青青于春水

中国医学影像技术 2021年9期
关键词:模型

张欣欣,杨青青,于春水,2,梁 猛*

(1.天津医科大学医学影像学院,天津 300203;2.天津医科大学总医院医学影像科,天津 300052)

格兰杰因果关系分析(Granger causality analysis,GCA)是揭示脑区间效应连接(effective connectivity,EC)的强有力工具,已广泛用于功能MRI(functional MRI,fMRI)研究[1-5]。利用GCA推断因果性的基本原理如下:若脑区X的时间序列在过去时刻的值对预测脑区Y的时间序列当前时刻的值有显著贡献,则认为脑区X的功能活动为因,Y则为果。因此,fMRI数据的时间分辨率可能是检测脑区间EC的潜在制约因素[6-7]。既往研究[6,8]基于仿真数据提出较高时间分辨率可提升GCA结果的稳定性和敏感性。目前fMRI数据最常用的重复时间(repetition time,TR)多为2~3 s。多层同步采集序列[9]的出现,将全脑fMRI采集时间缩短至亚秒级,而这是否会对GCA结果产生显著影响目前尚不得而知。本研究观察fMRI时间分辨率对基于GCA模型的脑EC的影响。

1 资料与方法

1.1 数据来源 基于人类大脑连接组计划(https://neuroscienceblueprint.nih.gov/human-connectome/connectome-programs),于公开数据库随机抽取40名健康受试者,男20名,女20名,年龄30~37岁,平均(34.3±1.1)岁。纳入标准:右利手,无神经或精神疾病史[10]。

1.2 数据预处理 采用梯度回波-回波平面成像(gradient echo-echo planar imaging,GRE-EPI)序列采集颅脑静息态fMRI(resting-state fMRI,rs-fMRI)数据,TE 33.1 ms,TR 720 ms,FOV 208 mm×180 mm,矩阵104×90,平面分辨率2 mm×2 mm,FA 52°,层厚2 mm,层数72,带宽2 290 Hz/Pixel,共采集1 200个时间点数据,采集时间14.4 min。采用Matlab R2013b和DPARSF软件行图像预处理,包括梯度失真校正、头动校正、EPI图像失真校正、空间配准、去除线性漂移、回归协变量和样条插值及带通滤波(0.01~0.08 Hz),见图1。

图1 受试者女,36岁 A~C.分别为预处理后脑部冠状位、矢状位及轴位fMRI数据图

1.3 fMRI数据下采样 为保证数据一致性,于上述预处理后,经时间下采样生成采集不同时间分辨率的fMRI数据。……

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