基于生物信息学分析免疫紊乱在类风湿关节炎发病机制中的作用▲
2021-09-22杨业静杜勇军李兴艳
杨业静 杜勇军 刘 雷 李兴艳
(广西南宁市第二人民医院关节骨科,南宁市 530031,电子邮箱:30764656@qq.com)
类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)为自身免疫性疾病,多累及小关节,以关节炎症、肿胀、疼痛为临床表现,女性多于男性,多高发于50~65岁人群。RA的全球患病率为0.5%~1.0%,我国的患病率约为0.42%[1]。近几年,RA患者因并发感染而住院的比例逐渐增加。一项对1993~2013年美国RA患者的大样本多中心流行病学调查显示,因感染住院的RA患者,从90/10万人增至206/10万人[2]。RA是威胁人民群众身体健康的重大疾病,也是心血管疾病的危险因素。但是RA的病因病机仍不十分明确,其发生与关节状态、饮食、代谢、家族遗传史等因素均有关。此外,越来越多的证据表明免疫紊乱参与了RA的发病,有学者在RA患者的滑膜组织中观察到白细胞介素(interleukin,IL)-1、IL-4等炎症免疫因子的浸润,以及自身抗体的沉积[3-4]。但是由于免疫系统疾病的复杂性,任何单一的假设均不能较好地解释免疫紊乱在RA发病中的作用机制。
生物信息学是一门新兴的学科,它将计算机与自然科学相联系,能用于解释复杂的生物机体,基因组学、代谢组学、蛋白质组学等均属于生物信息学范畴,该学科的发展为了解生理病理变化提供了新的思路。GEO数据库是用于储存芯片及测序数据的一个数据库,利用现有的公共生物数据库能整合多组不同实验室的结果,更好地挖掘潜在的信息。因此,本研究利用公共数据库,并联合多个RA滑膜组织的芯片,分析RA的差异表达基因以及免疫相关基因,进一步筛选T、B细胞的关键基因,并利用单细胞测序数据验证关键基因的表达,以探讨免疫紊乱在RA发病中的作用机制,并筛选小分子药物以干预RA。……
