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基于生物信息学方法的人类GLTP在胰腺腺癌发生发展中的作用及其表观遗传调控机制分析

2021-09-09马梅燕冀慎英张湘豫卢梦云邹先琼

激光生物学报 2021年4期
关键词:数据库人类水平

马梅燕,冀慎英,张湘豫,卢梦云,邹先琼

(1. 桂林医学院附属口腔医院,桂林 541004; 2. 桂林医学院 a. 生物技术学院;b. 基础医学院,桂林 541100)

人类糖脂转运蛋白(glycolipid transfer protein,GLTP)的空间结构是由α-螺旋组成的特别的两层“三明治”状结构,这种“三明治”状结构被认为是真核生物GLTP蛋白家族的结构基础及原型蛋白[1]。GLTP位于人类12号染色体(基因座12q24.11)上,编码一个可溶的约24 kD的糖脂转运蛋白,介导糖鞘脂(glycosphingolipid,GSL)膜间转运并调节细胞内GSL的稳态水平[2]。GLTP被认为在葡萄糖神经酰胺代谢中发挥作用,其过表达会导致细胞内葡萄糖神经酰胺的合成和转移显著增加[3]。然而,决定特定糖鞘脂蛋白选择性的机制以及GLTP如何结合到目的膜和最终释放到受体膜的过程仍不清楚[4-5]。特异性蛋白1(specificity protein 1,Sp1)及特异性蛋白3(specificity protein 3,Sp3)能调控GLTP的表达,而神经酰胺处理改变了Sp1及Sp3与GLTP启动子结合的亲和性,降低了Sp3的乙酰化水平[6]。迄今为止,人类GLTP在肿瘤发生发展中的作用及其表观遗传调控机制的研究尚未见于文献。

表观遗传调控涉及DNA甲基化、组蛋白修饰和microRNA(miRNA)的作用等,与炎症、癌症、神经系统疾病、心血管疾病和自身免疫疾病等的发生发展密切相关。DNA甲基化是一种重要的表观遗传调控机制,哺乳动物的DNA甲基化主要发生在胞嘧啶-鸟嘌呤二核苷(cytosine-guanine dinucleotide,CpG)中[7]。在组蛋白修饰中,组蛋白H3K4Me1的分布可预测转录的状态和启动子的激活,在与关键染色质调控因子的结合中起重要作用[8-9]。组蛋白H3K4Me3存在于真核生物基因组启动子区域,通常被认为是一种激活的调控方式,可介导基因的转录激活,在基因转录中具有指示作用[10]。……

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