徐俊 侯玉洁 谢敏 王梦芝 邬磊 费丹 周瑶敏 胡丽芳

徐俊（1986-），博士，主要從事动物营养与质量安全风险评估研究工作。先后主持国家自然科学基金项目、江西省重点研发计划项目及江西省协同创新项目等国家级或省部级科研项目6项;作为主要成员参与国家自然科学基金项目、国家科技支撑计划项目及农业农村部农产品质量安全风险评估等科研项目10余项。获江西省科技进步奖一等奖1项，农业农村部农产品质量安全中心科普奖2项;制定地方标准6项;获授权国家发明专利3项、实用新型专利5项;获软件著作权3项;参编著作5部;在《Journal of Integrative Agriculture》《Asian-Australasian Journal of Animal Sciences》《Frontiers in Microbiology》《动物营养学报》《南方农业学报》《分析试验室》等科技期刊上发表学术论文20余篇。

摘要：【目的】探讨矮脚黄鸡口服利巴韦林后其肠道微生物群落结构多样性的变化情况，揭示抗病毒药物对动物肠道健康的影响机制，为科学禁用抗生素及开发绿色生态饲料提供理论依据。【方法】90日龄矮脚黄鸡按10 mg/kg的剂量连续口服利巴韦林溶液7 d（试验组），以口服等量生理盐水为对照组，停药后收集4 h内的新鲜鸡粪。通过粪便基因组提取试剂盒提取鸡粪总DNA，根据细菌16S rDNA序列V3～V4可变区，设计通用引物338F和806R进行PCR扩增，然后参照Illumina MiSeq平台上机说明进行Illumina MiSeq高通量测序。【结果】从16个矮脚黄鸡粪便样品中共获得614626条原始序列（Raw reads），经质量控制后获得606862条优质序列（Clean reads），按97%的序列相似度进行OTU聚类分析获得968个OTUs，对照组和试验组共享624个OTUs。矮脚黄鸡肠道微生物群落丰富度指数（Chao1和ACE）表现为对照组显著（P<0.05，下同）或极显著（P<0.01，下同）高于试验组;在物种多样性方面，Simpson指数的组间差异不显著（P>0.05），Shannon指数则表现为试验组显著高于对照组。……