纤维素降解菌Raoultella ornithinolytica LL1的筛选及基因组测序
2021-08-11唐昊孙灿李沅秋罗朝兵
唐昊 孙灿 李沅秋 罗朝兵
(乐山师范学院生命科学学院,乐山 614000)
植物生物质主要由木质纤维素组成,是地球上最丰富的生物质组成部分。由于木质纤维素可作为生物燃料制备的可持续资源,因此其降解过程受到广泛关注[1]。纤维素是葡萄糖单体的聚合物,通过β-1,4-糖苷键连接,是木质纤维素生物质资源中最常见的成分之一[2]。大量文献报道,纤维素聚合物的降解需要多种碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)家族成员的协同作用,这些酶家族之间通过多重互补和协调氧化、水解和非水解活性共同作用实现碳水化合物的降解[3]。关于纤维素水解成葡萄糖单体的过程,其需要3种酶的协同作用,包括内葡聚糖酶、外葡聚糖酶和β-葡萄糖苷酶[4]。在微生物中,如木霉属(Trichoderma)[5]、曲霉属(Aspergillus)[6]和青霉属(Penicillium)[7]等真菌分泌的纤维素降解酶已被广泛的研究,但细菌较真菌而言,具有生长速度更快、多酶复合物表达和极端环境的耐受性等优势,已成为目前纤维素酶生产研究的重点[8-10]。许多归属于芽孢杆菌属(Bacillus)[11]、类芽胞杆菌属(Paenibacillus)[12]、纤 维 菌 属(Cellulomonas)[13]、噬纤维菌属(Cytophaga)[14]等纤维素分解微生物都能产生纤维素降解酶。
研究表明昆虫共生微生物可降解由纤维素、半纤维素和木质素组成的植物细胞壁[15]。这些微生物包括细菌和真菌,帮助宿主昆虫利用植物细胞壁材料中的单糖。目前已有大量研究从昆虫肠道中筛离得到纤维素降解细菌,如黄胜威等[16]从暗黑鳃金龟幼虫肠道中分离得到假单胞菌属Pseudomonas,微杆菌属Microbacterium,德沃斯氏菌属Devosia等属中能够降解纤维素的细菌,其中Pseudomonass属中的消化还原假单胞菌Pseudomonas nitroreducens是暗黑鳃金龟幼虫肠道内最主要的纤维素降解菌;……
