核酸内切酶Surveyor酶切法快速检测MTB对吡嗪酰胺耐药性方法的建立及评估
2021-08-11胡严杰龚世伟任易
胡严杰 龚世伟 任易
吡嗪酰胺(pyrazinamide,PZA)作为常用的一线抗结核药品[1-2],能在吡嗪酰胺酶(pyrazinamidase,PZase)的作用下生成吡嗪酸(pyrazinoic acid,POA),中性条件下以POA-的形式存在,一部分POA-通过外排作用转运到细胞外,在酸性环境下,POA-被还原成不带电荷的POA分子。由于POA的动态平衡,不带电荷的分子再次被转运到细胞内,因为POA进入细胞时带一个质子,经过大量累积后使细胞质酸化,导致细菌死亡,从而发挥抗结核作用[3-5]。此外,PZA也可将治疗周期从9~12个月缩短至6个月[6]。因此,成为结核病短程化疗的基石。
PZase是由结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)的pncA(561 bp)基因编码的蛋白,PZase编码基因及其启动子序列的突变是造成PZase活性降低或缺失的主要原因[7-8],也是PZA耐药的主要原因。PZase编码基因及其启动子序列的突变形式包括点突变、插入和缺失,可能发生突变的碱基几乎覆盖了整个基因,因此不便于应用常用的基于探针杂交的分子检测技术。Surveyor酶是植物中提取的核酸内切酶,它可特异性切割DNA错配部位,无特异酶切核苷酸序列,并已用于MTB乙胺丁醇耐药基因突变的检测[9]。本研究采用核酸内切酶Surveyor酶切法测定MTB对PZA耐药性,并与BACTEC MGIT 960法检测结果和基因测序结果进行对比,评估该方法的临床应用价值。
材料和方法
一、菌株来源
MTB标准菌株H37Rv(ATCC27294)、PZA耐药的MTB标准株BCG(ATCC 34540),以及91株(选取106株,最终复苏成功91株)耐多药MTB菌株均来自武汉市肺科医院。
二、 PCR扩增
50 μl PCR扩增体系包括25 μl Taq Master Mix(2×),5 μl模板分别来自H37Rv、BCG或91株耐多药MTB临床分离株,其中H37Rv扩增时上游引物∶下游引物分别为1∶1、5∶4、5∶3、5∶2;临床株扩增时上游引物∶下游引物分别为1∶1、4∶5、3∶5、2∶5,最后加dd H2O补足至50 μl。……
