不同年龄段女性胶质母细胞瘤差异蛋白组学分析
2021-08-10兰春燕李海南戴利军邵佳芬高华方
兰春燕 李海南 王 磊 戴利军 邵佳芬 高华方,* 马 旭
1.国家卫生健康委科学技术研究所(北京,100081);2.北京协和医学院研究生院;3. 广东三九脑科医院
胶质瘤是最常见的原发性颅内中枢神经系统肿瘤[1],约占颅内恶性肿瘤的80%,其中胶质母细胞瘤(GBM)是恶性程度最高的胶质瘤,患者病情发展隐匿,即使经过最积极的治疗,中位生存期仅为15个月[2]。研究表明,不同性别的患者驱动GBM发展的过程及对治疗反应方面存在差异,且年龄也是GBM预后的重要评判指标[3]。Ohgaki等[4]对751例不同年龄组GBM患者的研究发现,年龄<50岁GBM患者的生存期为8.8个月;而年龄≥50岁组GBM患者的生存期为4.1个月,即年龄≥50岁的晚发GBM患者的预后比中青年患者差[5]。多项研究致力于从基因层面探寻胶质瘤的新的治疗靶点[6-7],但由于蛋白是细胞生物学功能的直接执行者,因此蛋白组学是分析GBM相关疾病的强有力的工具[8]。本研究采用蛋白组学技术对不同年龄段女性GBM患者的差异表达蛋白进行分析,寻找与年龄相关的差异表达蛋白,并通过生物信息学分析为不同年龄段GBM女性患者的靶向诊疗提供思路。
1 资料与方法
1.1 临床资料
纳入广东省三九脑科医院2018-2020年收治的18例GBM女性患者为研究对象,患者中位年龄49岁(20~71岁)。其中年龄<50岁10例;≥50岁8例。本研究获得广东三九脑科医院伦理委员会的批准,患者或家属均知情同意并签署知情同意书。本研究符合《赫尔辛基宣言》。
1.2 样本制备与数据采集
所有组织样本均通过手术或活检的方式取自GBM患者脑部肿瘤病变区域。18例GBM活检组织均从-80℃冰箱取出,进行样本预处理。蛋白提取后,采用Bradford蛋白定量试剂盒进行蛋白浓度的测定,并通过凝胶电泳实验对条带清晰度等的判断进行蛋白质检。取120μg蛋白样品经胰蛋白酶酶解,采用18C除盐柱进行除盐后,进入质谱仪内上机检测。采用数据依赖采集(DDA)的方式进行真实谱图库的构建。使用配有Nanospray FlexTM(ESI)离子源的Q ExactiveTMHF-X 质谱仪进行数据的采集,设定离子喷雾电压为2.5kV,离子传输管温度为320℃,质谱全扫描范围为m/z 350-1500,使用高能碰撞解离(HCD)方法碎裂进行二级质谱检测。下机后的文件直接导入到Proteome Discoverer 2.2软件进行数据库的检索及蛋白的定量分析。
1.3 统计学分析
使用Excel软件筛选在所有GBM样本中均表达的蛋白。……
