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基于16S rRNA高通量测序的野生和养殖多鳞白甲鱼肠道微生物群落组成研究

2021-08-10苟妮娜钟明智王开锋

西北农业学报 2021年7期

苟妮娜,钟明智,王开锋

(1.陕西省动物研究所,陕西省秦岭珍稀濒危动物保育重点实验室,西安 710032;2.西北农林科技大学 动物科技学院,陕西杨凌 712100)

多鳞白甲鱼(Onychostomamacrolepis)又称多鳞铲颌鱼,是一种杂食性淡水经济鱼类,隶属鲤形目(Cypriniformes),鲤科(Cyprinidae),鲃亚科(Barbinae),白甲鱼属(Onychostoma)[1]。该鱼常见于秦巴山区、鄂西山地及鲁中南山地[2],因其味道鲜美、营养丰富而深受消费者喜爱[3]。近年来,受气候变化及水利工程影响,多鳞白甲鱼野生资源量呈下降趋势[4],被《中国脊椎动物红色名录》评估为VU(易危)等级[5]。因此,具有重要的种质资源保护价值及人工养殖开发前景。随着人工养殖技术的发展,多鳞白甲鱼养殖规模逐渐扩大,然而各种疾病也随之而来。抗生素类药物拌料投喂以及化学试剂溶液浸浴是目前普遍采用的治疗方法[6],然而药物疗法不但污染水质,而且威胁水产品健康。因此,如何提高鱼类自身免疫能力及抗病力成为近年来水产品健康养殖的研究热点。有研究表明,肠道微生物菌群参与鱼类营养[7]、免疫[8]和疾病爆发[9-10]等一系列生理过程。

动物的肠道由复杂的动态微生物生态系统组成,从营养、生理和病理学的角度来看,肠道微生物非常重要。肠道微生物菌群在宿主体内具有多种功能,通过促进营养供应、防止感染源寄居、能量稳态的维持和正常的粘膜免疫,它们对宿主的营养和健康的重要性在哺乳动物中已经得到很好证实[11-13]。鱼类的肠道微生物通常来自周围的水环境,土壤、沉积物以及饲料,这些微生物聚集在肠道中形成肠道微生物群落[14-18]。……

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