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基于网络药理学探讨姜黄-白芍治疗类风湿关节炎协同机制

2021-08-04任妮娜姚血明陆道敏马武开

安徽医科大学学报 2021年7期

凌 益,徐 晖,黄 颖,任妮娜,唐 芳,姚血明,陆道敏,马武开

类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种侵蚀性多关节炎为主要症状的自身免疫性疾病。RA中国大陆发病率为0.42%,患病人群约500万,男女患病比率约为1∶4。RA的发病机制尚不明确,姜黄-白芍药对具有破血行气,通经止痛的功效,其是治疗RA的常用中药。现代药理研究表明姜黄、白芍均可通过抗氧化、抗炎、镇痛、调节免疫等途径治疗RA。因成分多、作用复杂,姜黄、白芍各自的单体研究不能确切体现该药对防治RA的功效。网络药理学是以生物信息数据为基础,综合药理学和生物活性等学科的知识和方法,探讨药物作用于疾病的可能机制。利用网络药理学方法和分析手段,探索姜黄-白芍治疗RA可能的协同机制,为后续实验提供参考。

1 材料与方法

1.1 姜黄-白芍活性成分的筛选

在中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database,TCMSP,http://lsp.nwsuaf.edu.cn/tcmsp.php/)分别检索“姜黄”、“白芍”,获得2味中药所有化合物成分。根据各化合物ADME(吸收、分布、代谢、排泄)性质的结果,以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)和药物相似度(drug likeness,DL)作为化合物成分的筛选条件,以OB≥30%、DL≥0.18筛选出姜黄、白芍活性化合物。此外,将已明确具有防治RA作用,但不满足OB和DL条件的化合物同样纳入姜黄-白芍的活性化合物中。

1.2 姜黄-白芍活性成分靶点的筛选

在TCMSP 数据库中,根据活性成分获取相应靶蛋白,将获得靶蛋白输入UniProt数据库(http://www.uniport.org/)检索,得到标准化基因名。另外,将活性成分输入PubChem(http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)数据库中查询其对应的SMILES,在SwissTargetPrediction数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/)输入活性成分的SMILES,获得活性成分的靶蛋白及基因名。……
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