TERT基因在乳头状肾细胞癌中的独立预后作用
2021-08-02刘殿勇张帅许亚坤高莉娟杨进益魏伟
刘殿勇,张帅,许亚坤,高莉娟,杨进益,魏伟
(大连医科大学 1.附属大连市儿童医院泌尿外科,辽宁 大连 116012;2.附属大连市友谊医院泌尿外科,辽宁 大连 116100)
肾乳头状细胞癌(papillary renal cell carcinoma,PRCC)是肾癌的第二常见类型,约占肾癌病例总数的15%~20%[1]。PRCC是一种异质性疾病,其潜在的分子机制还不完全清楚[2]。此外,靶向治疗对晚期PRCC患者的疗效尚不确定。目前,人们对确定PRCC患者预后的最佳风险基因特征尚未达成共识[3]。因此,迫切需要寻找新的预后生物标志物和治疗靶点来提高PRCC患者的生存率。
随着高通量基因检测技术的发展,生物医学大数据被广泛应用[4-5]。从单个样本中收集大量的基因组信息,从而可以识别新的预后、预测或药效生物标志物[6]。目前,基因表达水平的微阵列或RNA测序数据常用于通过Cox风险回归模型构建新的预后特征。通过微阵列和测序方法以及可用的开放存取数据库如癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA),已经在PRCC等多种癌症中发现生物标志物,为在全球基因水平上筛选预后基因提供了机会[7]。
本研究利用TCGA数据库中PRCC患者的基因表达谱数据和临床信息,对正常人和PRCC患者的基因进行差异分析,基于差异基因筛选与患者生存显著相关的基因,并进一步探讨该基因是否能成为新的PRCC预后标志物,为PRCC患者的治疗提供新靶点。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 细胞系:人胶质瘤细胞系SK-RC-39(中国科学院上海细胞所)。
1.1.2 主要试剂:高糖DMEM培养基(美国Gibco公司);胎牛血清(天津市灏洋生物制品科技有限责任公 司);TRIzol试 剂、Lipofecamine 2000、cDNA-TERT和阴性对照(美国Invitrogen公司);……
