PAX9基因在肺鳞状细胞癌中的表达及其临床意义▲
2021-07-28黄浩石硕王永勇谭翔戴磊梁冠标陈铭伍
黄浩 石硕 王永勇 谭翔 戴磊 梁冠标 陈铭伍
广西医科大学第一附属医院心胸外科,南宁市 530021
肺癌是世界上发病率和死亡率极高的癌症[1],其中肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC)是一种常见的非小细胞肺癌亚型,占所有肺癌的25%~30%[2]。LUSC与吸烟密切相关,癌细胞中的靶向驱动基因频率可能较低,具有高度的异质性,目前有效的靶向药物少,给临床精确治疗带来了很大的困难。配对盒(paired box, PAX)基因是一类进化保守的基因家族,PAX基因是与生长发育调控相关的转录因子,参与多种细胞内信号转导通路的调控,在胚胎发育、组织器官形成和分化中发挥关键作用[3]。PAX9在多种肿瘤组织中异常表达,在人类口腔黏膜鳞状细胞癌和唾液腺肿瘤中高表达[4],而在食管鳞状细胞癌和黑色素瘤中低表达[5-6]。Hsu等[7]报道,PAX9参与了多种细胞信号通路如Wnt、PI3K/AKT和BMP等,并受原癌基因c-myb的调控,PAX9基因可能在LUSC的发生、发展中起重要作用。本研究就PAX9基因在LUSC中的表达情况和临床意义进行了探讨,现将结果报告如下。
1 材料与方法
1.1 数据库的采集和整理 从TCGA官方网站(https://portal.gdc.cancer.gov/)获取TCGA-LUSC数据集,数据集包括488例LUSC患者的基因测序数据和预后数据。从Gene Expression Omnibus数据库(GEO,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)获取GSE21933数据集和GSE73403数据集。GSE21933数据集包括11例成对的LUSC组织和邻近正常肺组织的测序数据,GSE73403数据集包括69例LUSC样本的临床和预后资料,用于生存分析。利用limma软件包对不同芯片的表达数据进行分位数归一化,使其达到同一水平。
1.2 LUSC患者癌组织及癌旁组织的PAX9基因表达检测 选取2019年6月至2020年11月广西医科大学收治的34例LUSC患者为研究对象,收集患者术后的LUSC组织和癌旁组织,病理学确认。……
