苏毅馨,李林潞,毛 昀，褚雪镭，陈 峥，朱世杰

(中国中医科学院望京医院肿瘤科，北京 100102)

食管癌是常见恶性肿瘤之一，每年造成40多万人死亡[1]，2018年中国食管癌新发病例占全球新发病例54.1%，死亡病例占全球死亡病例56%[2]。食管鳞癌(ESCC)是主要的组织学亚型，占90%以上[3]。目前常规治疗方式包括手术、放疗、化疗、靶向治疗、免疫治疗等，但ESCC患者的5年生存率低于30%[4]。研究表明，相关基因及信号通路的改变可导致肿瘤细胞的早期转移及高侵袭性，如RTK/RAS/PI3K通路中TP53、 CCND1基因突变等[5]，因此亟须进一步探讨ESCC分子机制，以期寻找ESCC早期诊断及靶向治疗潜在的生物标志物。

近年来，基因芯片技术及生物信息学已广泛应用于基因组学的研究，LU等[6]分析ESCC中DNA甲基化驱动基因，发现ABCD1、CCDC8等基因异常与患者生存预后相关。本研究通过整合公共基因芯片数据库(GEO)中GSE17251、GSE45670基因芯片数据集，利用GEO2R和Venn图在线工具获得两数据集中共同差异表达基因(DEGs)，其次通过DAVID在线网站及R语言进行基因本体(GO)和基因组百科全书数据库(KEGG)分析并将其可视化，然后，通过SPRING在线工具及Cytoscape软件中MCODE(Molecular Complex Detection Technology)插件筛选出核心DEGs。最后将核心DEGs导入GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)在线数据库进行表达差异及预后分析获得与ESCC预后相关基因，并利用UALCAN在线数据库验证其在ESCC组织与正常组织表达差异性，探索ESCC预后的相关生物标志物。

1 材料与方法

1.1 ESCC数据收集及差异基因筛选

NCBI(National Center for Biotechnology Information)平台GEO数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)是公开的微阵列/基因图谱公共数据库，利用该数据库进行基因芯片筛选。目标芯片的准入标准：(1)临床ESCC患者标本，排除细胞株和动物实验；……