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人参活性成分Rg3通过CASP8诱导胆管癌细胞凋亡作用研究
——基于网络药理学筛选及实验验证

2021-06-25吴可人

浙江中医杂志 2021年6期
关键词:数据库

宋 爽 张 敏 吴可人

浙江中医药大学附属第一医院 浙江 杭州 310006

胆管癌(cholangiocarcinoma)是一种起源于胆管上皮细胞且具有较高恶性程度的肿瘤[1]。手术是唯一能够治愈胆管癌的手段,但早期发现困难,只有约35%的患者能够早期发现并接受根治性手术,而晚期无法行手术治疗的患者,中位生存期仅为3~6个月[2]。基于化疗对胆管癌患者的重大意义,逆转MDR是对抗胆管癌的重要任务和提高患者生活质量的有效方式。人参(Panax ginsengC.A.Meyer)是五加科植物人参Panax ginseng C.A.Meyer的干燥根和根茎,属多年生草本植物,具有大补元气、补脾益肺、生津养血、安神益智的功效。现代药理学研究发现,人参具有抗增殖、抗血管生成、抗炎、抗氧化和抗肿瘤等特性[3]。人参对肝癌[4]、结肠癌[5]、皮肤癌[6]等多种肿瘤有明确作用。本研究基于网络药理学研究人参活性成分Rg3通过CASP8诱导胆囊癌细胞凋亡作用。

1 材料与方法

1.1 收集疾病、药物靶基因:在GeneCards和Online Mendelian Inheritance in Man在线数据库输入“cholangiocarcinoma”,检索并收集胆管癌相关体内基因。本研究中涉及的生物物种均设计为“homo sapiens(human)”。借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSPp)挖掘“人参”的活性成分及靶标,后经UniProt查询对应靶标的基因名。

1.2 蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络构建:在Venn在线工具中分别输入人参和胆管癌靶基因,可直接获取Venn图及两者交集基因。将交集基因导入STRING在线数据库,隐藏无连接的节点,即可得到PPI网络。

1.3 基因表达验证和生存分析:借助Gene Expression Profiling Interactive Analysis(GEPIA)数据库进行交集基因表达验证和生存分析。

1.4 通过CCK-8实验考察对Hucct-1细胞增殖作用:细胞培养:Hucct-1细……

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