右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991 的全基因组分析
2021-06-18王珊珊石继春杜宗利石刚龙新星叶强徐颖华
王珊珊,石继春,杜宗利,石刚,龙新星,叶强,徐颖华
中国食品药品检定研究院卫生部生物技术产品检定方法及其标准化重点实验室,北京102629
右旋糖酐(dextran)也称葡聚糖,是一种以葡糖苷键连接形成的高分子化合物,因其具有安全、无毒、生物相容性好等优点,在临床上被广泛用于代血浆或补铁剂[1]。《中国药典》二部(2020 版)中收载了右旋糖酐 20、40 和 70 及其不同制剂[2]。右旋糖酐制备方法主要有微生物发酵法和酶合成法,目前国内临床级右旋糖酐主要是由肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991(原编号为LM-1226)作为生产用菌种,发酵合成高分子葡聚糖,再经酸水解、乙醇沉淀及烘干最终获得不同分子量的右旋糖酐终产品[1,3]。
生产用菌种是药品研究、生产和检定的物质基础,其质量直接与药物终产品的安全性和有效性密切相关[4]。肠膜状明串珠菌能发酵糖类产生多种酸和醇,具有高产酸、抗氧化和拮抗致病菌等能力,被广泛应用于右旋糖酐和各种食品调味剂的生产,并有望成为新型微生态制剂[1]。最近研究表明,肠膜明串珠菌包括4 个亚种:肠膜亚种(L.mesenteroides subsp.mesenteroides)、右旋葡聚糖亚种(L.mesenteroides subsp.dextranicum)、乳脂亚种(L.mesenteroides subsp.cremoris)和 L.mesenteroides subsp.jonggajibkimchii[5]。目前对肠膜状明串珠菌生产用菌种的质量控制主要包括形态观察、培养特性和发酵率等传统项目,缺乏菌株水平分子特征方面的评价。因此,基于药品生产用菌种的菌株溯源、制剂工艺优化以及检定等方面考虑,了解该生产用菌种的分子特征和遗传背景显得尤为重要。本研究首次应用高通量测序技术,对右旋糖酐生产用菌种肠膜状明串珠菌CMCC(B)34991 进行全基因组序列测定,分析其基因组基本特征,与其他4 种亚种代表菌株进行比较基因组学分析,并探讨其系统发育进化关系。……
