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环状RNA hsa_circ_0070421对甲型流感病毒复制的影响

2021-06-17张玳宁于秀华

中国兽医学报 2021年5期
关键词:功能研究

张玳宁,于秀华,张 舒,段 铭*

(1.吉林大学 动物医学学院 人兽共患病研究所 人兽共患病研究教育部重点实验室,吉林 长春 130062;2.吉林大学 第一医院,吉林 长春 130021)

环状RNA(circular RNA,circRNA)是近些年才发现的一种新的内源性非编码RNA,具有独特的闭合环状结构,由前体mRNA反向剪接产生[1]。大约40年前,这些环状转录本被认为是mRNA剪接的副产物[2],但随着RNA测序技术的发展,现在已发现数以千计的circRNA。已有的研究结果表明,circRNA表达具有较高的组织特异性和发育阶段特异性,且在基因表达调控中具有重要的生理功能[3],在癌症、心血管疾病、中枢神经系统疾病等生理病理进程中扮演了重要的角色。

甲型流感病毒(influenza A virus,IAV),属于正黏病毒科,单股负链RNA病毒,对人类及动物的生命健康具有重大危害,但是宿主编码的circRNA在IAV与宿主细胞相互作用中的功能及其机制尚不清楚[4]。本实验室前期基于基因芯片技术分析circRNA在IAV感染A549细胞中的表达,发现hsa_circ_0070421的表达显著上调[5]。本研究探讨了hsa_circ_0070421在IAV感染过程中的表达及其功能,研究结果有助于认知circRNA在IAV与宿主相互作用中的作用。

1 材料与方法

1.1 主要试剂聚肌苷酸胞苷酸(Poly I:C)和大肠杆菌O55:B5的脂多糖(LPS)购自Sigma-Aldrich公司;Cisplatin购自MedChem Express公司;超纯琼脂糖凝胶(UltraPure Agarose)购自Invitrogen公司;抗IAV-M1抗体购自Abcam公司;抗β-actin抗体购自Cell Signaling公司。

1.2 细胞培养A549和THP-1细胞在含有10%胎牛血清(FBS)(HyClone)和100 U/mL青霉素和100 mg/L链霉素的RPMI-1640(Corning)中培养;将MDCK、A172、Caco-2和SH-SY5Y细胞维持在含10% FBS的DMED(Corning)中培养,并置于37℃、4%CO2培养箱中生长。

1.3 病毒和病毒感染将流感病毒株A/PR/8/34(H1N1)在11日龄鸡胚尿囊腔中增殖。用PBS洗涤细胞,并用感染复数(MOI)=3的病毒与含有1 mg/L TPCK处理的胰蛋白酶(Sigma-Aldrich)的培养基一起孵育1 h,吸附后,吸出上清液,将细胞培养指定的时间。……

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