侵染番茄的曲叶病毒检测及遗传变异分析
2021-06-15田培洁李诗君张松柏张德咏
田培洁 李诗君 张 宇 刘 勇, 张松柏, 张德咏,*
(1 湖南农业大学植物保护学院,湖南长沙 410120;2 湖南大学研究生院隆平分院,湖南省农业科学院,湖南长沙 410125)
番木瓜曲叶病毒(papaya leaf curl virus,PaLCuV)、广东番茄曲叶病毒(tomato leaf curl Guangdong virus,ToLCGDV)和广西番茄曲叶病毒(tomato leaf curl Guangxi virus,ToLCGXV)均属双生病毒科(Geminiviridae)菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus),基因组为单链环状DNA,长度为2.5~3.0 kb(Varun et al.,2017)。主要侵染双子叶植物如番茄(Solanum lycopersicum)、番木瓜(Carica papaya)、西番莲(Eclipta prostrata)、木薯(Manihot esculentaCrantz)和棉花(Gossypium)(Huang &Zhou,2006;Zhang et al.,2010),以及杂草如田麻(Corchoropsis timentosa)、胜红蓟(Ageratum conyzoidesL.)和金盏菊(Siegesbeckia orientalisL.)等(蔡建和等,2007;Venkataravanappa et al.,2019)。曲叶病毒侵染作物,造成叶片严重卷曲、畸形,植株矮化,严重影响作物产量和品质(Varun et al.,2017)。
曲叶病毒在自然条件下,仅由烟粉虱传播,且烟粉虱传毒效率高、速度快(Guo et al.,2015)。我国广西、广东、河南、云南、海南、福建和四川等省都有曲叶病毒发生危害的报道(Zhou et al.,2001;Wang et al.,2004;张鲁斌 等,2005;熊艳等,2014;谢丽雪 等,2019),呈现随传播介体烟粉虱快速扩展而快速扩散的趋势,因此,急需开展双生病毒在我国的发生、分布及其危害程度研究,明确其对我国重要经济作物的潜在威胁。
本试验于2017—2019 年,采集了我国5 个省份(甘肃、广西、海南、河北和云南)疑似感染曲叶病毒的番茄样本,采用特异性PCR 及常规测序,检测鉴定曲叶病毒种类,并对PCR 扩增序列进行系统发育和分子进化分析,研究结果可为曲叶病毒的流行分析和致病性研究提供科学依据。
1 材料与方法
1.1 材料
2017—2019 年,在甘肃、广西、海南、河北和云南等省番茄主产区共采集疑似感染曲叶病毒的病叶168 份。
1.2 叶片总DNA 抽提
叶片总DNA抽提采用CTAB 法(Zhang et al.,2010)。将叶片加入液氮研磨,加入CTAB试剂和氯仿/异戊醇(体积比24∶1)后涡旋振荡,12 000 r · min-1离心5 min 去除沉淀;……
