检测山羊嵴病毒的实时荧光定量PCR方法的建立和应用
2021-05-28阿比克哈莫余忠华景志忠
阿比克哈莫,余忠华,景志忠*,汤 承
(1.中国农业科学院兰州兽医研究所 家畜疫病病原生物学国家重点实验室 农业部兽医公共卫生重点实验室,兰州 730046;2.阿坝藏族羌族自治州动物科学技术研究所,红原 624400;3.西南民族大学畜牧兽医学院,成都 610041)
嵴病毒(kobuvirus,KoV)是小RNA病毒科一个新的属。2019年,国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)根据KoV的Polyprotein、P1、2C和3CD区氨基酸相似性进一步将其划分为Aichivirus A~F 6个种以及未分类的挪威鼠嵴病毒、灰松鼠嵴病毒和蝙蝠嵴病毒3个种[1]。其中,Aichivirus A成员的人爱知病毒,Aichivirus B成员的牛嵴病毒和Aichivirus C成员的猪嵴病毒为腹泻病原[2-6]。另外Aichivirus A成员的猫嵴病毒和犬嵴病毒也与腹泻相关[7-8]。
目前,在羊中发现了两种不同种的KoVs:绵羊嵴病毒(ovine kobuvirus,OKoV)和山羊嵴病毒(caprine kobuvirus,CKoV),OKoV是Aichivirus B的成员,而CKoV是Aichivirus C的成员[1]。OKoV首次在匈牙利绵羊的健康粪便样本中检测到[9],随后在巴西绵羊的健康、腹泻粪便样本和爱尔兰绵羊肠系膜淋巴结中都检测到了OKoV[7,10]。而CKoV最早是在韩国黑山羊的腹泻粪便样本中检测到[11-12],随后又在意大利山羊的健康和腹泻粪便样本中检测到[13],2019年,ICTV将CKoV确定为Aichivirus C成员[1]。最近本实验室在四川某地山羊腹泻山羊粪样本中检测到CKoV,证实了该病毒在国内的存在,并获得一个近似完整的基因组[14]。此外,在意大利鹿的粪样中也检测到CKoV[15],表明其可能具有跨种间传播的能力。到目前为止,国内外CKoV流行病学资料仍然匮乏,并且缺乏合适的分离CKoV的细胞培养体系,因此该病毒对山羊的致病性仍不清楚。
目前,GenBank数据库中有3个CKoV基因组序列,包括本实验室上传的1个中国毒株。……
