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猪肠道细菌培养组学研究进展

2021-05-28周梦情陈从英

畜牧兽医学报 2021年5期
关键词:研究

周梦情,陈从英

(江西农业大学 猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室,南昌 330045)

养猪业在我国国民经济中占有非常重要的地位,为人们提供了主要的肉食种类。同时,猪也是研究人类生理功能和疾病的重要模型动物[1],与人体健康联系较紧密。猪的重要经济性状受到其肠道微生物组成、结构和功能的影响。因此,猪肠道菌群是近年来的研究热点领域之一。猪肠道细菌培养组学的研究也越来越重要,主要原因是:1)细菌16S rRNA基因测序技术能以极低的成本对猪肠道菌群进行分析,但只能精确到细菌属及属以上分类水平,对于种或种以下水平的分类难以确认[2]。对于微生物群落的研究,只分类到属是远不够的。2)1998年 开始的宏基因组分析包含了可培养与未培养的微生物。宏基因组研究揭示了肠道菌群的多样性,但其难以区分丰度较低的菌株[3]。通过宏基因组可发现人体肠道中大量未培养菌株信息(约70%)[4]。宏基因组物种鉴定依赖已知数据库信息,但还有大量物种无法鉴定;许多样品中的优势物种目前并不存在已培养的参考菌株,再加上技术方面的问题,这些都在影响着宏基因组的发展。3)通过分离培养出优势物种的代表菌株,可通过测序得到其基因组信息,研究该菌株的功能以及用无菌小鼠进行功能验证,可扩大对人类或其他哺乳动物肠道微生物组成和多样性的认识,证实肠道菌群与宿主表型性状的因果关系,研究其作用机制等[5]。……

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