环状RNA circTMBIM 1在肝细胞癌中的表达和功能研究①
2021-05-28陆滢雪罗新华程明亮贵州医科大学附属医院感染科贵阳550004
陆滢雪 罗新华 程明亮 彭 虹 (贵州医科大学附属医院感染科,贵阳550004)
近年来,环状RNA(circRNA)的功能备受关注,如调节亲本基因表达、发挥miRNA海绵体等作用[1-3]。研究表明,circRNA参与肿瘤发生发展[4-5]。原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是全球恶性肿瘤相关死亡的常见原因,预后差、复发率高,其发病机制受到高度关注[6-7]。最新研究表明,大量circRNA在HCC组织和正常肝组织中存在差异表达,与HCC发生发展和预后密切相关,但具体作用机制尚未明确[8-10]。本文就circRNA在HCC中的异常表达进行分析,探讨其在HCC中的作用和潜在机制。高通量测序发现,circTMBIM1在HCC组织中表达上调,因此,课题组对Hsa-circTMBIM1在HCC细胞系中的表达进行RT-PCR定量分析,并设计合成靶向Hsa-circTMBIM1的小干扰RNA(siRNA),将其转染至Huh7细胞,研究Hsa-circTMBIM1与Huh7细胞增殖和迁移的关系。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 细胞系 人HCC细胞株HepG2、Hep3B、Huh7、Sk-hep-1、HCCLM3、SMMC-7721购自上海生命科学院所;慢病毒稳转细胞株由南京科佰生物科技有限公司提供;引物由北京擎科生物有限公司合成;靶向circTMBIM1的siRNA序列委托广州锐博生物公司设计合成;
1.1.2 主要试剂与仪器 DMEM细胞培养基(美国Hyclone公司);胎牛血清(美国Gibco公司);青-链霉素(武汉苑陵生物科技有限公司);miR-24-3p模拟物(上海吉玛生物有限公司);miR-24-3p抑制剂和阴性对照(上海生工生物公司);CCK-8试剂盒(日本Dojindo公司);结晶紫染色液(碧云天公司);碘化丙啶、Lipofectamine 3000转染试剂盒、荧光素酶报告基因质粒(美国Sigma公司);Transwell小室(美国Coster公司);Trizol试剂(美国Invitrogen公司);酶标仪(美国Thermo公司);Muse智能触控细胞分析仪(美国默克密理博公司);荧光定量PCR仪(美国ABI公司);双荧光素酶报告基因测定系统(Promega,Madison,WI,USA)。
1.2 方法……
