基于化学蛋白组学发现天然产物作用靶点的方法探析
2021-05-27陈秀珍严馨宇喻程郦张毅楠
南京中医药大学学报 2021年3期
关键词:方法
陈秀珍,严馨宇,喻程郦,张毅楠
(南京中医药大学药学院,江苏 南京 210023)
中医药源自中华民族几千年的健康养生理念及实践经验总结,其产生疗效主要依靠天然原材料所含有的各种化学成分对有机体产生药理作用[1]。从中医药和世界各民族传统医学出发,或者从随着科学技术进步发现的新天然资源出发,天然产物及其衍生物为药物研发提供了重要的资源,创制了许多不可或缺的药物。与合成类杂环药物相比,源于天然产物及衍生物的药物在结构多样性、活性独特性等方面具有显著优势[2-4]。天然药物发现过程中,往往先发现它们的表型活性,遵循正向药理学的研究途径。与使用靶蛋白高通量筛选发现先导化合物,进而依次推进细胞、组织、动物、人体试验的小分子合成药物,具有显然的区别。
现代药物发现过程中,一般要明确药物的具体作用靶蛋白,这有助于深入地阐明药物的作用机制、识别潜在毒性、克服可能的耐药机制。因此天然产物表型活性明确后,往往要通过不同手段发现其作用靶点,从而通过结构改造提高活性和规避各种毒副作用。与此同时,这个过程还有可能帮助发现疾病所对应的新作用靶点,是天然药物开发应用的关键步骤[5-6]。
传统的X射线晶体衍射、核磁共振技术仅可用于单一蛋白靶点的分析,对从诸如细胞等复杂生物系统中进行靶点分析往往需要借助质谱技术[7-8]。化学蛋白质组学是基于质谱的蛋白质组学的重要分支,包含多种用于捕获并鉴定天然产物靶蛋白的方法。……
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