Toll样受体基因组特征与直肠癌临床病理及免疫参数的相关性分析
2021-05-21李昂仵红娇谢俞宁贾祯贤李佳莹张雪梅
李昂,仵红娇,谢俞宁,贾祯贤,李佳莹,张雪梅*
1华北理工大学公共卫生学院,河北唐山 063210;2华北理工大学生命科学学院,河北唐山 063210
结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是世界上第三大常见癌症,也是导致癌症患者死亡的第二大原因[1]。美国癌症协会的流行病学调查显示,直肠癌在CRC中占比达35%。作为先天免疫的重要组成部分,炎症是癌症发生和进展的标志性特征[2]。Toll样受体(Toll like receptors,TLRs)是特殊的模式识别受体(pattern recognition receptors,PRRs),可诱导免疫细胞表面相关分子的表达而激活免疫应答途径,还可与相应配体结合激活炎症通路[3]。据统计,除环境危险因素(包括肥胖、缺乏运动、不良饮食、饮酒和吸烟)外,1/3的直肠癌是由遗传因素诱导发生的[4-5],而单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)在人类的可遗传变异中较为常见。调节区和3'非翻译区SNP可分别通过调节与转录因子或miRNA的结合,从而对靶基因调控产生影响[6]。因此,具有潜在功能的SNP可能会增加机体对癌症的易感性。有研究发现,TLR3调控区基因多态性与肠道病毒71型(EV71)重症感染的易感性相关[7],而肠道感染也是CRC的诱因之一[8]。鉴于TLRs在肿瘤中的重要作用,本研究通过查阅文献并利用生物信息学方法筛选出5个潜在的功能SNP位点,探讨其对CRC发病风险的影响,以期为CRC的防治及早期诊断提供理论依据。
1 资料与方法
1.1 研究对象 本研究采用病例对照的研究策略。选取2008-2016年在华北理工大学附属唐山市工人医院和华北理工大学附属唐山市人民医院住院治疗的480例经组织病理学确诊且采血前未接受放化疗的原发性直肠癌患者设为病例组,另随机选取同期在唐山地区进行体检的480名健康者设为对照组,排除与病例组有血缘关系、有肿瘤家族史、接受放射治疗或者抗癌化学药物治疗的个体。……
